施工单位偷顶管高速公路的处罚对象是施工单位，而非甲方，具体处罚需根据违法情节的严重程度确定。以下从法律责任主体、处罚依据及具体情形展开分析：

一、法律责任主体：施工单位是直接违法者

根据《公路法》《公路安全保护条例》等法律法规，未经许可擅自占用、挖掘公路或进行其他影响公路安全的行为，责任主体为实施违法行为的单位或个人。本案中：

1. 施工单位是直接操作方：偷顶管行为（即未经审批在高速公路下方暗挖管道）由施工单位具体实施，其作为行为主体需承担法律责任。
2. 甲方通常不直接担责：若甲方未参与违法决策或实施（如未指使、默许施工单位违法），则不承担行政处罚责任。但若甲方存在过错（如明知施工单位违法仍同意施工），可能需承担连带民事赔偿责任或行政责任（如被认定为共同违法主体）。

二、处罚依据及具体情形

处罚需结合违法情节的严重程度，依据《公路法》第七十六条、《公路安全保护条例》第六十二条等规定，可能面临以下处罚：

1. 行政处罚

• 罚款：由公路管理机构责令停止违法行为，处3万元以下罚款（一般情节）；若造成公路损害，处违法所得3倍以下但不超过3万元的罚款（无违法所得时）。
• 责令恢复原状：要求施工单位限期修复被破坏的公路设施，恢复原状。
• 其他处罚：若涉及超限运输、未采取安全防护措施等，可能叠加处罚（如《超限运输车辆行驶公路管理规定》第四十三条）。

2. 刑事责任（严重情节）

• 破坏交通设施罪：若偷顶管行为导致高速公路塌陷、车辆倾覆等严重后果，可能构成《刑法》第一百一十七条规定的破坏交通设施罪，处3年以上10年以下有期徒刑；造成特别严重后果的，处10年以上有期徒刑、无期徒刑或死刑。
• 重大责任事故罪：若因违法施工导致重大伤亡事故，施工单位相关责任人可能构成《刑法》第一百三十四条规定的重大责任事故罪。

3. 民事赔偿

施工单位需赔偿因违法施工导致的公路修复费用、交通中断损失、第三方人身财产损害等。

三、特殊情形：甲方可能担责的情况

若甲方存在以下过错，可能被追究责任：

1. 共同违法：甲方与施工单位合谋或指使违法施工，构成共同违法主体，需共同承担行政处罚责任。
2. 未履行监管义务：甲方作为建设单位，若未对施工单位资质、施工方案进行审查，或未监督其依法施工，可能因未尽到管理职责被追究行政责任（如罚款、责令整改）。
3. 合同约定责任：若施工合同中明确约定甲方需承担违法施工责任（如“甲方承担一切法律后果”），可能依据合同约定承担部分责任，但此类条款可能因违反法律强制性规定而被认定无效。

建议

1. 施工单位：立即停止违法行为，主动与公路管理机构沟通，配合调查并修复公路，争取从轻处罚。
2. 甲方：核查自身是否参与违法决策或实施，若未参与则无需过度担忧；若存在过错，建议积极协商赔偿，避免行政处罚升级。
3. 争议解决：若对处罚有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。

如有进一步疑问，可直接向我咨询，我将结合具体案情提供详细法律分析。