结论：离职后，若安全员证书是由公司出资办理且仍留在公司，您需要根据公司与您之间的约定、证书的性质以及相关法律法规来综合判断如何处理。以下是从不同角度给出的详细分析和建议。

一、证书性质与归属

1. 公司出资办理，但属于个人资质证书：

   • 如果安全员证书是您个人通过考试获得的，只是公司出资支付了考试费用或培训费用，那么该证书在法律上仍属于您的个人资质证书。
   • 在这种情况下，即使公司出资，您也有权要求公司归还证书，因为证书本身代表的是您的个人能力和资质。

2. 公司出资办理，且证书与公司业务紧密相关：

   • 如果证书是公司为了开展特定业务而为您办理的，且该证书的使用与公司业务紧密相关，那么证书的归属可能需要根据您与公司之间的约定来确定。
   • 如果双方没有明确约定，一般来说，证书仍应归您个人所有，但公司可能因业务需要而要求您在一定期限内将证书留在公司使用。

二、公司与您之间的约定

1. 有书面约定：

   • 如果您与公司之间有书面约定，明确规定了证书的归属、使用期限以及离职后的处理方式，那么双方应按照约定执行。
   • 如果公司违反约定，拒绝归还证书，您可以通过法律途径维护自己的权益。

2. 无书面约定：

   • 如果没有书面约定，那么您需要与公司进行协商，明确证书的归属和离职后的处理方式。
   • 在协商过程中，您可以强调证书的个人属性以及您对证书的所有权，同时考虑公司的业务需求，寻求双方都能接受的解决方案。

三、法律法规依据

1. 《中华人民共和国劳动合同法》：

   • 根据该法，劳动者在离职时，有权要求用人单位归还其个人物品和证件，包括各类资质证书。
   • 如果公司拒绝归还，您可以向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，要求公司归还证书并可能承担相应的法律责任。

2. 其他相关法律法规：

   • 除了劳动合同法外，还可能涉及其他与证书管理、个人权益保护相关的法律法规。
   • 在处理此类问题时，建议您咨询专业律师或相关机构，以获取更准确的法律意见。

四、建议与行动

1. 与公司协商：

   • 首先，尝试与公司进行友好协商，明确证书的归属和离职后的处理方式。
   • 在协商过程中，保持冷静和理性，寻求双方都能接受的解决方案。

2. 寻求法律援助：

   • 如果协商无果，您可以咨询专业律师，了解自己的法律权益和可能的维权途径。
   • 律师可以根据您的具体情况，为您提供更详细的法律建议和帮助。

3. 采取法律行动：

   • 如果公司拒绝归还证书且协商无果，您可以考虑向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。
   • 在采取法律行动前，请确保您已收集了足够的证据来支持您的主张。

最后，离职后安全员证书的处理问题需要根据具体情况来判断。如果您对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据您的具体情况，为您提供更详细和专业的法律建议。