结论前置：辞职后，若您的安全员证已经注册到公司，您有权要求原单位归还或协助转出该证书。若原单位无故拒绝，您可以通过沟通协商、投诉举报及法律途径等维护自己的合法权益。以下是详细解答：
一、安全员证的处理方式
1. 证书已注册在原单位
协商转出：
- 首先，建议您与原单位进行友好沟通，明确表达离职意愿及希望将安全员证从原单位转出的需求。
- 双方应依据劳动合同或其他协议中的约定处理证书使用及离职后事宜。若协议中有关于证书转出的条款，原单位有义务配合执行。
- 若原单位无故拒绝协助转出，您可以向其说明此行为可能违反劳动法规或行业管理规定，要求其改正。
投诉与举报：
- 如协商无果，您可以向当地劳动监察部门投诉，请求其对原单位进行监督检查，并责令其改正违法行为。
- 同时，您也可以向证书的行业主管部门反映情况，由其依据行业管理规定督促原单位配合办理证书转出事宜。
法律途径维权：
- 若上述方法均未能解决问题，您可以考虑通过法律途径维权。具体步骤包括：向劳动争议仲裁机构申请仲裁，要求原单位履行协助转出安全员证的义务；若仲裁结果不满意，还可向人民法院提起诉讼。
- 在整个法律程序中，您应注意收集相关证据，如沟通记录、书面通知、投诉举报记录等，以支持自己的诉求。
2. 证书属于个人考取，但已注册在原单位（此情况与上述1类似，但强调证书归属）
- 即使证书是您个人考取的，但一旦注册在原单位，其使用和管理就受到原单位和行业规定的约束。因此，您仍需按照上述协商转出、投诉举报或法律途径等步骤来处理。
二、注意事项
保留证据：
- 在整个过程中，您务必保留好所有与原单位的沟通记录、书面通知、投诉举报记录等证据。这些证据在后续的法律程序中可能起到关键作用。
了解法律法规：
- 您应了解相关的法律法规和政策规定，如《劳动合同法》等，以便更好地维护自己的合法权益。例如，《劳动合同法》明确规定用人单位不得无故扣押劳动者的证件或物品。
及时行动：
- 一旦发现原单位无故拒绝归还或协助转出安全员证，您应及时采取行动，避免延误时机导致权益受损。
三、可能的法律后果
- 若原单位无故扣押您的安全员证，可能面临劳动监察部门的处罚或行业主管部门的监管措施。
- 若您通过法律途径维权并胜诉，原单位可能需要承担赔偿损失、恢复名誉等法律责任。
最后建议：辞职后处理安全员证的问题可能涉及多个方面，包括与原单位的沟通、投诉举报以及法律途径等。为了更好地维护自己的权益，我建议您在处理过程中保持冷静、理性，并遵循上述建议和步骤。如果您在处理过程中遇到任何困难或疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。