针对您提出的“被土地部门撤销登报作废的国有土地使用证，时隔12年又办理了国有土地使用证，应如何处理”的问题，以下是我的详细解答：

1. 核实新证的合法性与有效性

   • 首先，您需要核实新办理的国有土地使用证的合法性和有效性。这包括确认土地部门是否按照法定程序重新进行了土地登记，新证上的信息是否准确无误，以及是否存在任何可能影响新证效力的法律瑕疵。
   • 您可以通过查询土地部门的登记记录、要求土地部门提供新证的办理依据和程序说明等方式，来确认新证的合法性和有效性。

2. 了解撤销与重新办理的具体原因

   • 接下来，您需要了解原国有土地使用证被撤销以及新证被重新办理的具体原因。这可能涉及到土地权属争议、违法用地行为、登记错误等多种情况。
   • 了解原因后，您可以根据具体情况判断新证的办理是否合法合理，以及是否存在需要进一步维权或申诉的空间。

3. 考虑法律救济途径

   • 如果您认为新证的办理存在违法或不合理之处，或者原证的撤销损害了您的合法权益，您可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。
   • 这可能包括提起行政复议，对土地部门的撤销和重新办理行为提出异议；或者提起行政诉讼，要求法院撤销新证或确认原证的撤销行为违法。
   • 在选择法律救济途径时，您需要充分考虑证据收集、诉讼成本、诉讼风险等因素，并咨询专业律师的意见以制定合适的诉讼策略。

4. 关注土地使用权的实际状况

   • 无论新证的合法性和有效性如何，您都需要关注土地使用权的实际状况。这包括土地的实际使用情况、是否存在权属争议、是否受到其他法律限制等。
   • 如果土地使用权存在争议或受到限制，您可能需要与相关方进行协商或采取其他措施来解决争议或解除限制，以确保自己的土地使用权得到保障。

行动建议：

• 建议您尽快收集相关证据材料，包括原国有土地使用证、新国有土地使用证、土地部门的登记记录、相关通知或决定等，以便在需要时提供证明。
• 如果您对新证的合法性和有效性存在疑问，或者认为自己的合法权益受到了损害，建议您及时咨询专业律师的意见，以便制定合适的维权策略。

在处理此类复杂法律问题时，请务必保持冷静和理性，依法维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。