核心结论：有营业执照但土地不合法，这种情况会面临一定的法律风险和经营限制，需要分情况采取不同措施来应对，具体如下：

1. 了解土地不合法的具体情况
   • 首先，要明确土地不合法的具体表现，是土地使用权取得不合法，比如未按照法定程序取得土地使用权、土地用途与规划不符，还是存在其他违法情形。例如，如果是通过非法转让、出租等方式获得土地使用权，这就属于土地使用权的取得不合法；若原本规划为农业用地，却用于工业建设，就是土地用途与规划不符。
   • 了解具体情况后，才能针对性地采取措施。如果是土地使用权取得不合法，可能需要重新按照法定程序去获取合法的土地使用权；若是土地用途问题，可能需要向相关部门申请变更土地用途。
2. 评估对营业执照和经营的影响
   • 短期影响：在短期内，土地不合法可能不会直接导致营业执照被吊销，但可能会面临相关部门的处罚，如罚款、责令限期整改等。例如，国土资源部门可能会对非法使用土地的行为进行罚款，并要求在规定期限内恢复土地合法用途。
   • 长期影响：从长期来看，如果土地问题一直得不到解决，可能会影响到企业的正常经营和发展。一方面，可能会面临持续的行政处罚，增加企业的运营成本；另一方面，在办理一些与土地相关的业务，如贷款、项目审批等时，会受到限制，甚至可能导致企业无法继续经营，进而影响到营业执照的有效性。
3. 采取相应的解决措施
   • 合法化土地使用：如果条件允许，尽量通过合法途径使土地使用合法化。比如，按照法定程序申请土地使用权变更登记、补办相关手续等。以工业用地为例，如果企业想要扩大生产规模，需要增加土地面积，可以通过参加土地出让招标、拍卖、挂牌等方式，合法取得土地使用权。
   • 调整经营策略：如果无法使土地合法化，或者合法化的成本过高，可以考虑调整经营策略。例如，将经营场所迁移到合法的土地上，或者改变经营模式，减少对当前土地的依赖。比如，一些原本在非法土地上开设的工厂，可以将生产环节迁移到合法的工业园区，而将销售、研发等环节保留在原址（如果原址其他方面合法）。
   • 与相关部门沟通协商：积极与当地的国土资源、规划等部门沟通，说明企业的实际情况和困难，争取得到他们的理解和支持。在沟通协商过程中，要提供相关的证明材料和解决方案，展示企业解决问题的诚意和能力。例如，企业可以制定详细的土地整改计划，并向相关部门承诺在一定期限内完成整改，以换取暂缓处罚或给予一定的整改时间。
4. 防范法律风险
   • 及时关注政策法规变化：土地相关的政策法规可能会随着时间和形势的变化而调整，企业要及时关注这些变化，确保自己的经营行为始终符合法律规定。例如，国家可能会出台新的土地利用政策，对某些行业的土地使用进行限制或鼓励，企业要根据政策变化及时调整自己的土地使用策略。
   • 保留相关证据：在与土地相关的交易、审批等过程中，要保留好相关的证据，如合同、文件、审批手续等。这些证据在日后可能出现的纠纷或处罚中，可以起到证明企业合法经营、积极整改的作用。比如，企业与土地出让方签订的土地出让合同，就是证明企业取得土地使用权合法性的重要证据。

总之，有营业执照但土地不合法是一个比较复杂的问题，需要根据具体情况采取相应的措施来解决。如果你还有其他关于这方面的问题，可以直接向我咨询。