对于未备案的设施农用地，其可能违反的土地管理相关条款及法律后果，主要可以从以下几个方面进行分析：

1. 违反土地利用总体规划：

   • 条款依据：根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，任何单位和个人进行建设，必须符合土地利用总体规划，不得擅自改变土地用途。设施农用地虽然属于农业用途，但若未按照土地利用总体规划进行备案和使用，就可能构成违规。
   • 法律后果：若设施农用地未备案且违反土地利用总体规划，相关部门可能会要求立即停止使用，进行整改，甚至可能面临拆除建筑物、恢复土地原状等行政处罚。

2. 违反农业产业发展规划：

   • 条款依据：除了土地利用总体规划外，农业产业发展规划也是设施农用地使用的重要依据。若设施农用地的建设不符合当地农业产业发展规划，同样可能构成违规。
   • 法律后果：对于不符合农业产业发展规划的设施农用地，相关部门可能会要求调整建设方案，使其符合规划要求，并补办备案手续。若无法调整或拒不调整，则可能面临行政处罚。

3. 未办理备案手续：

   • 条款依据：设施农用地的使用需要向当地农业部门或土地管理部门进行备案，这是确保土地合规使用的重要环节。若未办理备案手续，即使设施农用地本身符合规划和用途要求，也可能因程序违规而面临处罚。
   • 法律后果：对于未备案的设施农用地，相关部门通常会要求限期补办备案手续，并可能需补缴相关费用。若逾期未补办或拒不补办，则可能面临罚款等行政处罚。

4. 占用永久基本农田：

   • 条款依据：永久基本农田是保障国家粮食安全和重要农产品供给的关键，其使用受到严格限制。若设施农用地未经批准占用永久基本农田，则构成严重违规。
   • 法律后果：对于占用永久基本农田的设施农用地，相关部门通常会要求立即拆除建筑物、恢复土地原状，并可能面临高额罚款等行政处罚。情节严重者，还可能被追究刑事责任。

针对未备案设施农用地的建议：

• 立即停止使用并整改：若发现设施农用地未备案或存在违规情况，应立即停止使用，并按照相关部门的要求进行整改。
• 补办备案手续：在整改完成后，应尽快向当地农业部门或土地管理部门提交申请，补办备案手续，确保土地合规使用。
• 加强管理和监管：作为用地主体，应建立完善的土地使用和管理制度，定期进行自查和整改，加强与相关部门的沟通和协调，确保设施农用地的合规性和可持续性。

总结：未备案的设施农用地可能违反土地利用总体规划、农业产业发展规划、未办理备案手续以及占用永久基本农田等相关条款。为避免法律风险和行政处罚，建议用地主体及时采取措施进行整改和补办备案手续，并加强土地使用和管理。若您在处理此类问题时遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。