设施农用地附属设施未经批准擅自改变备案方案建设，主要违反了《中华人民共和国土地管理法》以及相关设施农用地管理政策的规定。以下从不同角度进行详细分析：

一、违反土地管理法的规定

1. 改变土地用途：

   • 根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，土地用途的变更必须依法经过批准。设施农用地附属设施的建设，若未经批准擅自改变备案方案，很可能涉及改变土地用途，如将农用地转为建设用地等，这是违法的。

2. 未经批准建设：

   • 设施农用地附属设施的建设，若未按照备案方案进行，且未经相关部门批准，即属于未经批准建设。这违反了土地管理法中关于建设用地审批的规定。

二、违反设施农用地管理政策

1. 破坏设施农用地管理秩序：

   • 设施农用地管理政策旨在规范设施农用地的使用和管理，保障农业生产的顺利进行。擅自改变备案方案建设，会破坏这一管理秩序，影响农业生产的稳定性和可持续性。

2. 可能面临处罚：

   • 根据设施农用地管理政策，对于未经批准擅自改变备案方案建设的行为，相关部门有权进行处罚，包括责令停止建设、限期改正、罚款等。在严重情况下，还可能面临拆除违法建筑、恢复土地原状等处罚。

三、法律后果与风险

1. 行政处罚：

   • 如前所述，擅自改变备案方案建设可能面临行政处罚，包括罚款、责令停止建设等。这些处罚不仅会对建设者造成经济损失，还可能影响其声誉和信誉。

2. 民事责任：

   • 如果擅自改变备案方案建设导致他人权益受损，如相邻土地使用权人受到损害，建设者还可能承担民事责任，包括赔偿损失等。

3. 刑事责任风险：

   • 在极端情况下，如果擅自改变备案方案建设涉及非法占用农用地、破坏耕地等严重违法行为，且情节恶劣、后果严重，建设者还可能面临刑事责任风险。

四、建议与措施

1. 立即停止建设：

   • 如果发现设施农用地附属设施的建设未经批准擅自改变了备案方案，应立即停止建设，避免进一步违法。

2. 申请补办手续：

   • 如果建设者认为改变备案方案是必要的，且符合相关规定和政策要求，应尽快向相关部门申请补办手续，获得批准后再继续建设。

3. 咨询专业律师：

   • 在处理此类问题时，建议咨询专业律师的意见和建议。律师可以根据具体情况提供法律分析和风险评估，帮助建设者制定合理的解决方案。

作为杨再坤律师，我专注于公司事务、刑事辩护、合同纠纷、婚姻家庭、房产纠纷、拆迁安置等领域。如果您在设施农用地附属设施建设方面遇到法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。