结论：员工法定医疗期届满仍需治疗的，公司发放工资的方式需根据具体情况判断，主要有以下两种处理方式及对应的工资发放标准。
情况一：员工不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作
- 法律依据：根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》第七条，企业职工非因工致残和经医生或医疗机构认定患有难以治疗的疾病，医疗期满，应当由劳动鉴定委员会参照工伤与职业病致残程度鉴定标准进行劳动能力的鉴定。被鉴定为一至四级的，应当退出劳动岗位，解除劳动关系，并办理退休、退职手续，享受退休、退职待遇。若未达到一至四级，但员工不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的，用人单位可以提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，解除劳动合同。
- 工资发放：在解除劳动合同前，公司需按照不低于当地最低工资标准的80%支付员工病假工资（具体比例可能因地区而异，需参照当地规定）。解除劳动合同后，公司需按照《劳动合同法》的规定支付经济补偿，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
情况二：员工医疗期满后继续治疗，但公司未解除劳动合同
- 法律依据：若公司选择不解除劳动合同，而是让员工继续治疗，此时员工仍处于病假状态。根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》及各地相关实施细则，员工在医疗期内享有病假工资待遇。
- 工资发放：公司需按照员工患病或非因工负伤前12个月的平均工资（或当地规定的病假工资基数）的一定比例支付病假工资。具体比例可能因地区而异，但通常不低于当地最低工资标准的80%。若员工医疗期满后继续治疗的时间较长，且公司未解除劳动合同，公司需持续支付病假工资直至员工康复或达到法定解除劳动合同的条件。
额外建议：
- 及时沟通：公司应与员工保持及时沟通，了解员工的病情及治疗进展，以便合理安排工作或调整病假工资待遇。
- 遵守当地规定：由于病假工资的具体标准可能因地区而异，公司需严格遵守当地的相关规定，确保工资发放的合法性和合规性。
- 考虑员工权益：在处理此类问题时，公司应充分考虑员工的权益和感受，避免因处理不当而引发劳动争议或法律纠纷。
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