行政处罚警告在法院双方自愿调解书达成后，与撤销处罚的关系需分情况讨论：
调解书内容未涉及行政处罚撤销：
- 若双方自愿达成的调解书仅就赔偿、道歉等民事责任进行了约定，而未涉及行政处罚的撤销或变更，那么该调解书的达成并不直接影响行政处罚的效力。行政处罚作为行政机关对违法行为的制裁，其撤销或变更需依据行政程序或行政诉讼程序进行，而非通过民事调解书直接实现。
调解书内容涉及行政处罚撤销：
- 在极少数情况下，如果调解书明确约定了行政处罚的撤销或变更，并且这种约定得到了行政机关的认可（例如，行政机关作为调解的一方参与，或者事后对调解书内容表示同意），那么该调解书可能成为行政机关撤销或变更行政处罚的依据。但这种情况较为特殊，需要满足严格的法律条件和程序要求。
调解书对行政处罚的间接影响：
- 即使调解书未直接涉及行政处罚的撤销，其达成也可能对行政处罚的执行产生间接影响。例如，如果调解书解决了因违法行为引发的民事纠纷，使得违法行为的后果得到了妥善处理，行政机关在考虑是否执行行政处罚时，可能会将调解书的达成作为参考因素之一。然而，这种间接影响并不改变行政处罚的法定效力和执行程序。
法律建议：
- 对于希望撤销行政处罚的当事人，应首先了解行政处罚的法定撤销条件和程序，包括向行政机关提出复议申请或向法院提起行政诉讼等途径。
- 在涉及民事纠纷和行政处罚的双重案件中，当事人可以尝试通过调解等方式解决民事纠纷，但这并不直接等同于行政处罚的撤销。调解书的达成应明确约定其法律效力和范围，避免产生误解或纠纷。
- 如果当事人认为行政处罚存在错误或不当之处，应及时咨询专业律师，了解自身权利和义务，并依法维护自己的合法权益。
可能法律后果：
- 如果当事人试图通过非法定程序（如仅通过民事调解书）撤销行政处罚，可能会面临行政处罚继续执行、法律程序无效等后果。
- 如果行政机关在未经法定程序的情况下撤销或变更行政处罚，可能会面临行政复议或行政诉讼的挑战，甚至需要承担相应的法律责任。
综上所述，行政处罚警告在法院双方自愿调解书达成后，与撤销处罚的关系并非绝对无关，而是取决于调解书的具体内容和行政机关的认可程度。在处理此类案件时，当事人应充分了解相关法律规定和程序要求，并依法维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。