结论：单位丢失在职员工6年前的合同，可能会面临一定的法律风险和责任，但具体影响需根据实际情况判断。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

一、合同丢失的法律后果

1. 对员工权益的影响：

   • 合同是员工与单位之间劳动关系的重要证明，丢失合同可能影响员工在维权时的证据提供，如工资、工时、福利待遇等方面的争议。
   • 但员工仍可通过其他证据（如工资条、工作证、考勤记录等）来证明与单位的劳动关系及具体权益。

2. 对单位责任的影响：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位有义务妥善保管劳动合同。丢失合同可能被视为单位管理不善，但并不直接导致法律责任的加重，除非因丢失合同导致员工权益受损且单位无法提供其他证据证明。
   • 若因合同丢失导致员工在维权时处于不利地位，单位可能需承担一定的赔偿责任，具体取决于员工因此遭受的实际损失。

二、应对措施与建议

1. 单位应采取的措施：

   • 立即补签或确认劳动关系：单位应尽快与员工补签劳动合同或出具书面证明，确认双方之间的劳动关系及具体条款，以弥补合同丢失的不足。
   • 加强合同管理：单位应建立健全的合同管理制度，确保劳动合同的妥善保管和及时归档，防止类似情况再次发生。
   • 积极配合员工维权：若员工因合同丢失而提出维权要求，单位应积极配合，提供必要的证据和协助，以维护员工的合法权益。

2. 员工可采取的措施：

   • 收集其他证据：员工应积极收集其他能够证明与单位劳动关系的证据，如工资条、工作证、考勤记录、同事证言等。
   • 与单位协商：员工可与单位协商补签劳动合同或出具书面证明，以明确双方的权利和义务。
   • 寻求法律援助：若员工与单位无法就合同丢失问题达成一致，可寻求法律援助或向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，以维护自己的合法权益。

三、特殊情况下的法律考量

• 若合同丢失涉及违法解除或终止劳动关系：若单位因合同丢失而违法解除或终止与员工的劳动关系，员工有权要求单位支付赔偿金，并可能涉及其他法律责任。
• 若合同丢失导致员工无法享受社会保险待遇：若因合同丢失导致员工无法享受社会保险待遇，单位可能需承担相应的赔偿责任，并可能面临行政处罚。

总结与建议：单位丢失在职员工6年前的合同，虽然可能带来一定的法律风险和责任，但通过积极采取措施、加强合同管理、配合员工维权等方式，可以有效降低风险并维护双方的合法权益。若遇到具体问题或争议，建议直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律意见和帮助。