员工可采取以下法律措施保护自身合法权益：

1. 明确自身法律地位，区分个人责任与公司责任
   根据《刑法》第三十条、第三十一条，单位犯罪需满足“以单位名义实施+违法所得归单位所有”两个条件。若员工仅履行职务行为（如按公司指令生产、销售），且未参与假冒注册商标的核心决策或利益分配，则一般不构成共同犯罪。关键点：需收集工资流水、工作指令记录、劳动合同等证据，证明行为与职务的关联性。

2. 立即申请取保候审，争取人身自由
   根据《刑事诉讼法》第六十七条，可能判处三年以下有期徒刑、无社会危险性的犯罪嫌疑人可申请取保候审。员工家属或律师可向公安机关提交《取保候审申请书》，附上员工无前科、固定居所、社会关系等证明材料。实务建议：取保候审成功率与案件情节、证据充分性直接相关，需同步委托律师介入与办案机关沟通。

3. 委托律师介入，开展刑事辩护与证据固定
   律师可依法会见员工，了解案情细节（如是否明知产品假冒、是否参与核心环节），并重点审查：

   • 公司是否伪造员工签名、虚构授权文件；
     
   • 员工是否被胁迫参与犯罪（如扣押工资、威胁解雇）；
     
   • 涉案产品数量、金额是否达到刑事立案标准（根据《刑法》第二百一十三条，假冒注册商标罪立案标准为非法经营数额5万元以上或违法所得3万元以上）。
     法律后果：若证据显示员工无主观故意或情节显著轻微，可争取撤销案件或不起诉。

4. 同步启动劳动仲裁，主张合法权益
   若公司因涉嫌犯罪被查封，员工可依据《劳动合同法》第三十八条，以“用人单位违法”为由解除劳动合同，并主张：

   • 结清未付工资及经济补偿金（按工作年限，每满一年支付一个月工资）；
     
   • 要求公司出具解除劳动合同证明，避免影响再就业；
     
   • 若公司未缴纳社保，可要求补缴或赔偿损失。
     操作流程：向公司所在地劳动仲裁委员会提交仲裁申请，附上劳动合同、工资条、考勤记录等证据。

5. 警惕“连带赔偿”风险，提前准备抗辩
   根据《民法典》第一千一百九十一条，若员工因故意或重大过失造成公司损失，公司可向员工追偿。但若员工仅履行普通职务行为（如按流程生产），且无重大过错，则无需承担赔偿责任。预防措施：保留工作记录、培训材料等证据，证明已尽合理注意义务。

行动建议：

• 家属应第一时间委托律师会见员工，了解案情并制定辩护策略；
  
• 同步收集劳动合同、工资流水、工作指令等证据，为后续维权做准备；
  
• 避免私下与公司协商赔偿，防止被诱导签署不利文件。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。