针对您提出的“承包土地种果树到期后怎么办”的问题，这是一个涉及合同、协商以及法律法规的综合性问题。以下是我为您提供的详细解答：
一、首要依据：合同条款
首先，您需要仔细查阅土地承包合同中是否有关于承包到期后果树归属和处理方法的明确条款。这是最直接且具有法律效力的依据。如果合同中有明确规定，比如果树归发包方所有、由承包方处理并给予一定补偿等，那么双方都应严格按照合同约定来执行。
二、合同无约定或不明确时的处理
如果合同中没有对果树处理作出明确规定，或者规定不够清晰，那么双方就需要进行协商。协商的过程中，可以考虑以下几个方面：
续订合同：如果双方都有继续合作的意愿，可以考虑续签承包合同，明确新的承包期限以及果树的管理权和使用权。
果树处置与补偿：如果不再续签合同，那么就需要协商果树的去留问题。承包方可以选择自行处理果树，但需要确保处理过程中不会对土地造成损害，并恢复土地原状。如果发包方愿意接收果树，那么双方需要就补偿金额进行协商。补偿数额应该综合考虑果树的价值、承包方在果树上的投入以及发包方可能因此获得的收益等因素。为了确保公平合理，双方可以共同委托有资质的评估机构对果树价值进行评估。
三、法律法规的保障
在处理果树问题的过程中，双方必须严格遵守相关的法律法规，特别是《中华人民共和国民法典》和《中华人民共和国农村土地承包法》等。这些法律法规为双方提供了行为准则和权益保障，确保处理过程的合法性和合规性。
四、协商不成时的法律途径
如果双方在协商过程中无法达成一致意见，那么可以寻求法律途径来解决争议。具体来说，可以向当地的农村土地承包仲裁机构或基层调解组织（如村民委员会、乡镇调解中心等）申请调解。这些机构对当地情况比较熟悉，有助于促成双方和解。如果调解无果，任何一方都有权向有管辖权的人民法院提起诉讼，由法院根据具体案情及相关法律法规作出公正判决。
总结与建议：
处理承包土地种果树到期后的问题时，应首先依据合同条款进行。如果合同无明确约定，则双方应秉持公平、合理的原则进行协商，并考虑续订合同或果树处置与补偿等方案。在整个处理过程中，必须严格遵守相关法律法规，确保双方行为的合法性和合规性。如果协商不成，可以寻求法律途径来解决争议。为了确保处理过程的顺利进行和双方权益的保障，建议双方在处理过程中保持理性沟通、尊重彼此权益，并考虑咨询专业律师或相关机构的意见。