结论：在房屋侵害案件中，若原告撤诉后法院进行调解但被告不同意，案件可能会进入不同的处理阶段，具体取决于原告是否重新起诉以及法院的后续操作。
分析说明：
原告撤诉后的法律状态：
- 原告撤诉意味着其放弃了当前的诉讼请求，案件在法律上视为未提起过诉讼（但撤诉记录会保留在案卷中）。
- 撤诉后，原告有权在法定期限内（通常是撤诉后六个月内，但具体需根据案件类型和地区规定）重新起诉。
法院调解被告不同意的情况：
- 若原告撤诉后，法院仍尝试进行调解（这通常发生在原告撤诉前已启动调解程序，或撤诉后双方仍有调解意愿并申请法院调解的情况下），但被告不同意调解方案，调解程序将终止。
- 调解终止后，若原告未重新起诉，案件将不会进入审判阶段，法院将不会对案件作出实体判决。
原告重新起诉后的处理：
- 若原告在法定期限内重新起诉，法院将受理案件并重新进入诉讼程序。
- 重新起诉后，法院将不再进行调解（除非双方再次申请），而是直接进行审理并作出判决。
- 在审理过程中，法院将依据事实和法律，对房屋侵害行为是否成立、责任如何承担等问题进行裁决。
被告不同意调解的法律后果：
- 被告不同意调解并不意味着其将承担不利的法律后果。调解是双方自愿的行为，任何一方都有权拒绝调解。
- 若案件进入审判阶段，被告需积极应诉，提供证据证明自己的主张，以维护自己的合法权益。
行动建议：
对于原告：
- 若您认为房屋侵害行为确实存在且需要法律救济，建议在撤诉后尽快重新起诉，以免超过法定期限。
- 在重新起诉前，收集并整理好相关证据，如房屋损害照片、维修记录、证人证言等，以支持您的诉讼请求。
对于被告：
- 若您不同意调解方案，且认为原告的诉讼请求不成立，可以明确拒绝调解并等待法院的进一步通知。
- 在案件进入审判阶段后，积极应诉并提交相关证据，以证明自己的清白或减轻责任。
特殊场景：
- 若在调解过程中，双方就部分问题达成一致但整体调解方案未获被告同意，法院可能会根据已达成一致的部分内容制作调解笔录或调解协议（但需双方签字确认才具有法律效力）。若被告最终未签字确认，则调解协议不生效，案件仍需通过审判解决。
后续法律流程：
- 若原告重新起诉，案件将进入立案、审理、判决等诉讼程序。
- 在审理过程中，法院将组织双方进行证据交换、开庭审理等环节，并最终根据事实和法律作出判决。
- 若对判决结果不服，双方均有权在法定期限内提起上诉。
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