结论：在约定付款后是否撤诉，这主要取决于双方的具体约定以及法律的相关规定。如果双方有明确的约定，且该约定不违反法律强制性规定，那么应当按照约定执行；如果没有明确约定或者约定违反法律，则撤诉与否并非必须按照付款来执行。以下是对此问题的详细分析：
一、有明确约定的情况
约定内容合法有效：
- 如果双方在合同或者和解协议中明确约定了“付款后撤诉”的条款，并且该条款不违反法律的强制性规定，不损害国家、集体或第三人的利益，那么该条款是合法有效的。
- 在这种情况下，一旦付款方按照约定支付了款项，收款方（即原告）通常应当按照约定向法院申请撤诉。
约定执行与违约责任：
- 如果收款方在收到款项后拒绝撤诉，可能构成违约。付款方可以依据约定要求收款方承担违约责任，包括但不限于要求返还已支付的款项、赔偿损失等。
- 同时，付款方也可以向法院说明情况，请求法院根据实际情况作出判断。如果法院认为撤诉符合法律规定和双方约定，可能会裁定准许撤诉；如果法院认为撤诉不符合法律规定或双方约定，可能会裁定不准许撤诉。
二、无明确约定或约定违法的情况
无明确约定：
- 如果双方没有明确约定“付款后撤诉”，那么撤诉与否通常取决于原告（收款方）的意愿。
- 原告可以根据案件的实际情况、自己的利益考量以及法律的规定来决定是否撤诉。
约定违法：
- 如果双方约定的“付款后撤诉”条款违反了法律的强制性规定，或者损害了国家、集体或第三人的利益，那么该条款是无效的。
- 在这种情况下，即使付款方支付了款项，收款方也没有义务必须撤诉。法院也会根据法律规定和案件实际情况来作出判断。
三、法律建议
明确约定：
- 为了避免纠纷和误解，双方在签订合同或和解协议时，应当明确约定“付款后撤诉”的具体条款，包括付款的金额、时间、方式以及撤诉的条件、程序等。
遵守法律：
- 双方在约定和执行过程中，应当遵守法律的强制性规定，不得损害国家、集体或第三人的利益。
及时沟通：
- 在付款和撤诉过程中，双方应当保持及时沟通，确保信息的准确传递和理解的统一。
寻求法律帮助：
- 如果双方在付款和撤诉问题上存在争议或无法达成一致，可以寻求专业的法律帮助，通过法律途径解决纠纷。
举例说明：假设甲和乙之间存在合同纠纷，双方约定甲向乙支付一定金额的款项后，乙向法院申请撤诉。如果甲按照约定支付了款项，但乙拒绝撤诉，那么甲可以依据约定要求乙承担违约责任，并可以向法院说明情况，请求法院根据实际情况作出判断。如果双方没有明确约定或者约定违法，那么撤诉与否将取决于乙的意愿和法院的判断。
后续思考：在实际操作中，双方应当充分考虑各种可能的情况和风险，并在合同或和解协议中作出明确约定。同时，双方也应当遵守法律的规定和道德准则，以诚信和合作的态度解决纠纷。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。