核心结论：员工工作中受伤但因自身操作不合规导致工伤保险不予赔付时，单位是否需要承担责任以及承担多少责任，需分情况讨论，具体如下：

1. 单位已尽到安全管理义务，无过错
   若单位能证明已依法为员工提供安全培训、配备防护设备、制定操作规程，且事故纯因员工故意违规（如明知故犯、严重违反操作流程）导致，根据《工伤保险条例》第十六条，单位通常无需承担工伤赔偿责任。但需注意：

   • 员工仍可通过民事诉讼主张单位存在“管理疏漏”（如设备老化未及时更换），此时单位可能需承担部分补充责任（比例由法院根据过错程度判定，通常较低）。
     
   • 若员工因伤致残或死亡，单位可能需从人道主义角度支付一次性补助（非强制，但实践中常见）。

2. 单位未尽到安全管理义务，存在过错
   若单位未提供安全培训、未配备防护设备、未明确操作规程，或明知员工违规操作却未制止，即使员工自身有过错，单位仍需承担主要赔偿责任。根据《民法典》第一千一百九十二条，责任划分可能如下：

   • 员工轻微过错（如疏忽大意）：单位承担80%-90%责任；
     
   • 员工重大过错（如故意违规）：单位承担50%-70%责任（具体比例由法院根据双方过错程度、因果关系等综合判定）。
     
   • 特殊情形：若单位行为构成“重大过失”（如明知设备存在安全隐患仍要求员工使用），可能需承担全部责任。

3. 第三方侵权导致受伤
   若员工受伤系因第三方（如设备供应商、其他单位人员）侵权导致，单位在承担赔偿责任后，可向第三方追偿。例如：

   • 设备故障导致受伤：若单位已尽到检查义务，可向供应商追偿；
     
   • 其他单位人员违规操作导致受伤：单位可向侵权方追偿。

建议：

• 单位应立即固定证据（如监控录像、操作记录、培训记录等），证明自身已尽安全管理义务；
  
• 与员工协商时，注意书面记录协商过程，避免口头承诺引发纠纷；
  
• 若争议较大，建议通过劳动仲裁或诉讼解决，由法院根据具体证据划分责任比例。
  

如有进一步细节（如单位是否签订劳动合同、是否购买雇主责任险等），可向我补充说明，我会为您细化分析。