在交通事故赔偿纠纷中，若两人受伤且一人同意调解、一人不同意调解，法院将根据不同情况分别处理，具体如下：

1. 调解程序中的处理方式
   根据《民事诉讼法》第97条，调解需以当事人自愿为前提。若一方明确拒绝调解，法院不得强制启动调解程序，但可分别询问双方意见：

   • 对同意调解的伤者，法院可组织其与责任方单独调解，达成协议后制作《民事调解书》，具有强制执行力；
     
   • 对不同意调解的伤者，法院将直接转入诉讼程序，由法官依法裁判赔偿金额。
     关键点：调解的自愿性原则决定了法院不会因部分当事人拒绝而否定其他当事人的调解意愿。

2. 诉讼程序中的处理方式
   若案件进入诉讼阶段，法院需合并审理两名伤者的诉求（属必要共同诉讼情形），但会分别认定各自损失：

   • 损失认定：法院将依据《民法典》第1179条，结合医疗记录、鉴定意见等证据，分别计算两名伤者的医疗费、误工费、护理费等实际损失；
     
   • 责任分配：根据交通事故责任认定书划分的责任比例（如主责70%、次责30%），分别确定责任方对两名伤者的赔偿金额；
     
   • 判决执行：若责任方未履行判决，两名伤者可分别申请强制执行，法院将按生效判决内容执行。
     例外情形：若两名伤者损失差异过大（如一人轻伤、一人重伤），法院可能考虑责任方履行能力，在执行阶段调整履行顺序。

3. 实务建议

   • 对同意调解的伤者：建议明确调解协议内容（如赔偿项目、金额、支付方式），避免因条款模糊引发后续争议；
     
   • 对不同意调解的伤者：需及时提交完整证据（如病历、收入证明等），确保法院准确认定损失；
     
   • 对责任方：若经济能力有限，可主动与两名伤者协商分期赔偿，或提供担保物（如房产、车辆）以促成调解。
     

总结：法院会尊重当事人调解意愿，对同意者单独调解，对拒绝者依法裁判，最终通过分别执行保障两名伤者的合法权益。如有具体证据或案件细节需分析，可进一步向我提供材料。