结论：请假一小时扣半天工资是否合法，需根据具体情况判断，一般情况下不合法，但若符合特定条件或双方有明确约定，则可能合法。以下从不同角度进行分析：
一、一般情况下的不合法性
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位扣除劳动者工资应当遵循合法、合理、公平的原则，且扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%，同时扣除后的工资不得低于当地最低工资标准。
- 请假一小时即扣除半天工资，显然超出了合理范围，且可能违反了工资扣除的比例限制和最低工资标准的规定。
合理性分析：
- 请假一小时对用人单位的生产经营影响较小，扣除半天工资显然过于严苛，不符合公平合理的原则。
- 此类规定可能损害劳动者的合法权益，引发劳动纠纷。
二、可能合法的情况
双方明确约定：
- 如果用人单位与劳动者在劳动合同或规章制度中明确约定了请假一小时扣半天工资的条款，且该条款不违反法律、行政法规的强制性规定，也不违背公序良俗，那么该条款可能被视为有效。
- 但即便如此，用人单位也应确保扣除后的工资不低于当地最低工资标准，且扣除比例合理。
特殊行业或岗位：
- 在某些特殊行业或岗位（如需要连续作业的生产线、医疗急救等），请假一小时可能对生产经营造成较大影响。
- 在这种情况下，用人单位可能通过与劳动者协商，制定更为严格的请假和工资扣除制度。但即便如此，也应确保制度的合法性和合理性。
三、法律建议
对于劳动者：
- 如果遇到用人单位无故扣除工资的情况，应首先与用人单位协商解决。
- 协商无果的，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
对于用人单位：
- 应制定合法、合理、公平的请假和工资扣除制度，并明确告知劳动者。
- 在扣除工资时，应确保扣除比例合理，且扣除后的工资不低于当地最低工资标准。
- 避免制定过于严苛或不合理的规定，以免引发劳动纠纷和法律风险。
四、可能的法律后果
如果用人单位的规定不合法：
- 劳动者有权要求用人单位补发被扣除的工资。
- 用人单位可能面临劳动监察部门的处罚或劳动仲裁机构的裁决，要求支付赔偿金等。
如果双方有明确约定且约定合法：
- 用人单位可以按照约定扣除工资，但应确保扣除后的工资不低于当地最低工资标准。
- 劳动者应遵守约定，按时请假并接受工资扣除。
总结：请假一小时扣半天工资是否合法，需根据具体情况判断。在一般情况下，此类规定可能不合法；但如果双方有明确约定且约定合法，或者属于特殊行业或岗位的特殊情况，则可能合法。无论如何，用人单位都应确保工资扣除制度的合法性和合理性，以维护劳动者的合法权益和避免法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。