员工在工厂车辆没有合法手续的情况下，确实有权拒绝驾驶该车辆。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
法律义务与权利：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》等相关法律法规，驾驶机动车上路行驶必须持有有效的行驶证、驾驶证等合法手续。这是驾驶人的法定义务。
- 如果工厂车辆没有合法手续，那么驾驶该车辆就违反了法律法规，员工有权拒绝执行这一违法行为，以保护自己的合法权益不受侵害。
安全风险：
- 没有合法手续的车辆往往可能存在安全隐患，如车辆性能不达标、未经过定期检验等。驾驶这样的车辆上路，不仅可能面临交通管理部门的处罚，更可能引发交通事故，危及员工自身和他人的生命安全。
- 员工有权拒绝驾驶存在安全隐患的车辆，这是对自己生命安全负责的表现。
劳动合同与劳动保护：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规，用人单位有义务为员工提供安全、健康的工作环境。如果工厂要求员工驾驶没有合法手续的车辆，这实际上是对员工劳动保护权益的侵害。
- 员工有权拒绝执行用人单位的违法指令，并可以向劳动监察部门投诉举报，维护自己的合法权益。
建议与行动：
- 如果员工遇到工厂要求驾驶没有合法手续的车辆的情况，应首先与工厂进行沟通，明确表达自己的拒绝态度，并说明拒绝的理由。
- 如果工厂坚持要求员工驾驶，员工可以向当地的劳动监察部门投诉举报，寻求法律援助和保护。
- 在处理此类问题时，员工应保留好相关证据，如工厂的要求通知、车辆手续缺失的证明等，以便在需要时提供给相关部门或法院作为证据。
总之，员工在工厂车辆没有合法手续的情况下有权拒绝驾驶，这是保护自己合法权益和生命安全的重要举措。如果遇到此类问题，员工应积极采取行动，维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。