在确认征迁补偿协议无效后，提起民事赔偿还是行政赔偿，这主要取决于协议无效的原因以及由此造成的损失性质。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 若协议无效是由于行政机关的违法行为导致：

   • 行政赔偿：如果征迁补偿协议无效是因为行政机关在征收过程中存在违法行为，如未依法进行公告、未听取被征收人意见、补偿标准违法等，且这些违法行为直接导致了被征收人的损失，那么被征收人通常有权提起行政赔偿。行政赔偿是针对行政机关及其工作人员在行使行政职权时侵犯公民、法人或其他组织合法权益造成的损害，由国家承担赔偿责任的一种制度。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国国家赔偿法》的相关规定，行政机关及其工作人员在行使行政职权时有侵犯人身权或财产权情形的，受害人有取得赔偿的权利。

2. 若协议无效是由于双方民事行为瑕疵导致，且损失与行政行为无直接关联：

   • 民事赔偿：如果征迁补偿协议无效是因为双方在签订协议过程中存在民事行为瑕疵，如欺诈、胁迫、重大误解等，且这些瑕疵导致的损失与行政机关的行政行为无直接关联，那么被征收人可能需要通过民事赔偿途径来维护自己的权益。民事赔偿是针对平等主体之间因侵权行为或违约行为造成的损害，由侵权方或违约方承担赔偿责任的一种制度。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，因一方当事人的违约行为，损害对方人身权益、财产权益的，受损害方有权选择请求其承担违约责任或者侵权责任。在征迁补偿协议无效的情况下，如果损失是由对方的违约行为或侵权行为造成的，被征收人可以要求对方承担民事赔偿责任。

3. 特殊情况下的综合考量：

   • 在某些特殊情况下，征迁补偿协议无效可能既涉及行政机关的违法行为，又涉及双方的民事行为瑕疵。此时，被征收人可能需要根据具体情况，综合考虑行政赔偿和民事赔偿的适用。例如，如果行政机关的违法行为是导致协议无效的主要原因，但双方在签订协议过程中也存在一定的民事行为瑕疵，那么被征收人可以同时提起行政赔偿和民事赔偿请求，但需注意避免重复赔偿。

建议与注意事项：

• 在确认征迁补偿协议无效后，被征收人应首先仔细分析协议无效的原因，以及由此造成的损失性质。
• 根据损失性质，选择合适的赔偿途径。如果损失主要由行政机关的违法行为导致，应优先考虑行政赔偿；如果损失主要由双方的民事行为瑕疵导致，且与行政行为无直接关联，则应考虑民事赔偿。
• 在提起赔偿请求前，建议被征收人收集并整理好相关证据材料，如协议文本、征收公告、补偿标准文件、损失证明等，以便在赔偿请求中充分证明自己的权益。
• 如有需要，被征收人可以向我咨询具体的法律问题和赔偿策略，以便更好地维护自己的合法权益。

总之，在确认征迁补偿协议无效后提起民事赔偿还是行政赔偿，需要根据具体情况进行综合考量。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我提问。