确认征地补偿协议无效的情况下，被征收人确实有权依法提起行政复议，以维护自身的合法权益。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据
《中华人民共和国行政复议法》的相关规定：
- 根据该法第六条，公民、法人或其他组织在认为行政机关的具体行政行为侵犯其合法权益时，有权申请行政复议。这明确包括了行政机关在征地补偿过程中作出的具体行政行为，如征地补偿协议的签订、执行等。
- 若行政机关在签订征地补偿协议过程中存在违法行为，如未依法公告、听证，或采用胁迫等手段迫使当事人签订协议，这些行为均可能侵犯被征收人的合法权益，从而成为行政复议的申请对象。
《中华人民共和国土地管理法》及实施条例的相关规定：
- 《土地管理法》规定，征收土地应当给予公平、合理的补偿，确保被征地农民原有生活水平不降低、长远生计有保障。这为被征地农民提供了通过法律途径维护自身权益的基础。
- 《土地管理法实施条例》进一步明确了征地补偿安置协议的签订和征地补偿安置决定的作出程序。如果被征收人对这些协议或决定不服，认为补偿不合理或协议无效，可根据《行政复议法》的相关规定申请行政复议。
二、申请行政复议的条件与程序
条件：
- 被征收人需认为征地补偿协议无效，且该无效情形是由于行政机关的违法行为导致的。
- 申请行政复议的期限通常为自知道该具体行政行为之日起六十日内，除非法律规定的申请期限超过六十日。同时，因不可抗力或其他正当理由耽误的申请期限，可自障碍消除之日起继续计算。
程序：
- 确定复议机关：通常向作出征地补偿协议的行政机关的上一级地方人民政府申请行政复议。
- 准备申请材料：包括行政复议申请书（载明申请人和被申请人的基本信息、复议请求、事实和理由、签名及日期）、身份证明、与征地补偿协议相关的证据材料（如协议文本、行政机关的公告、听证记录等）等。
- 提交申请：将申请材料提交给选定的复议机关，复议机关将在五日内进行审查，决定是否受理。
- 复议审理与决定：复议机关受理后，将全面审查征地补偿协议的合法性、程序合规性等。一般情况下，应在受理申请之日起六十日内作出复议决定；复杂情况可适当延长，但延长期限最多不超过三十日。
三、复议结果及后续救济
复议结果：
- 行政复议机关将根据法律规定和事实情况，作出维持、修改或撤销征地补偿协议的决定。如果认为协议无效是由于行政机关的违法行为导致的，可能会撤销或修改该协议，并责令行政机关重新作出合法的补偿决定。
后续救济途径：
- 如对复议决定不服，被征收人可在规定期限内提起行政诉讼，通过司法程序进一步维护自身合法权益。
四、实际操作建议
在提起行政复议时，被征收人应明确复议请求和理由，并提供充分的证据材料支持自己的主张。证据可能包括但不限于征地补偿方案、补偿安置协议、行政机关的公告、听证记录、现场照片或视频等。同时，被征收人应注意在法定的申请期限内提出复议申请，并遵循复议程序的要求。
综上所述，确认征地补偿协议无效时，被征收人完全有权依据《中华人民共和国行政复议法》及相关法律法规提起行政复议，以维护自身的合法权益。在实际操作中，应遵循相关法律法规的规定，确保复议请求的合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。