结论：同一起违法建设是否可以由两个部门进行行政处罚，需根据具体情况判断，一般而言，若两个部门分别依据不同的法律法规且针对不同的违法行为或违法情节进行处罚，则可能不违反“一事不再罚”原则；但若针对同一违法行为重复处罚，则可能构成违法。

分析：

1. “一事不再罚”原则：

   • 这是行政处罚中的一个基本原则，指的是对违法行为人的同一个违法行为，不得以同一事实和同一依据，给予两次或者两次以上的处罚。
   • 该原则旨在防止行政机关对同一违法行为进行重复处罚，保护当事人的合法权益。

2. 不同部门依据不同法律法规处罚：

   • 在违法建设的情况下，可能涉及多个法律法规，如城乡规划法、土地管理法等。
   • 如果两个部门分别依据不同的法律法规，且针对的是违法建设中的不同违法行为或违法情节（如一个部门处罚违法占地，另一个部门处罚违反规划），则可能不违反“一事不再罚”原则。

3. 同一违法行为重复处罚：

   • 如果两个部门都针对同一违法行为（如同一处违法建设）进行处罚，且处罚的依据和事实相同，则可能构成对“一事不再罚”原则的违反。
   • 在这种情况下，当事人可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。

4. 实际操作中的考量：

   • 在实际操作中，各部门之间应加强沟通协调，避免对同一违法行为进行重复处罚。
   • 如果确实需要多个部门共同参与处罚，应明确各自的职责和处罚范围，确保处罚的合法性和合理性。

建议：

• 对于违法建设者而言，应了解并遵守相关法律法规，避免违法行为的发生。
• 如果面临多个部门的处罚，应仔细审查处罚决定书，了解处罚的依据和事实，确保自己的合法权益不受侵害。
• 如有必要，可以寻求专业律师的帮助，通过法律途径维护自己的权益。

法律后果：

• 如果违反“一事不再罚”原则进行重复处罚，当事人可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，要求撤销或变更重复的处罚决定。
• 行政机关如果违反该原则进行处罚，可能面临被上级机关责令改正、被法院判决撤销处罚决定等法律后果。

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