结论：旷工三天自动离职且没有劳动合同的行为，其合法性及后果需分情况讨论。关键在于用人单位的规章制度是否明确且合法、劳动合同是否有相关约定（尽管未签合同），以及解除程序是否合规。同时，未签订劳动合同本身已构成用人单位的违法行为。
一、旷工三天自动离职的合法性分析
规章制度明确且合法：
- 若用人单位依法制定的规章制度中明确将旷工三天规定为严重违反规章制度的行为，并且该规章制度的制定经过了民主程序（如职工代表大会讨论通过），且已向劳动者公示或告知（例如通过员工手册、培训、公告栏等方式），则用人单位依据该规章制度以旷工三天为由解除劳动合同是合法的。但需注意，即使在这种情况下，用人单位也不能随意克扣工资，扣除部分应合理且不得低于当地最低工资标准。
规章制度不明确或违法：
- 若用人单位的规章制度未明确规定旷工三天的后果，或者规定不合理、过于严苛，或者规章制度的制定程序不合法（如未经过民主程序、未向劳动者公示或告知），则用人单位以旷工三天为由解除劳动合同属于违法解除。
未签订劳动合同的情况：
- 无论是否签订劳动合同，只要存在实际的用工行为，即视为建立了劳动关系，受《中华人民共和国劳动法》及相关法律法规保护。用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，需向劳动者每月支付二倍的工资作为赔偿。因此，未签订劳动合同本身已是用人单位的违法行为，劳动者可依法主张相应赔偿。
二、旷工三天自动离职的工资处理
- 工资扣除的合理范围：
- 用人单位若因旷工扣除工资，扣除部分应与劳动者旷工所造成的实际损失相当。通常做法是按天扣除，但扣除后的工资不得低于当地最低工资标准。若用人单位以旷工为由扣除过多工资，导致劳动者实际所得低于最低工资标准，此行为违法，劳动者有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
三、劳动者的权益保障与建议
了解规章制度：
- 劳动者应先查看用人单位的规章制度或咨询相关部门负责人，了解具体的旷工及工资扣除规定。
维护合法权益：
- 如对处理结果有异议，劳动者应及时向当地劳动监察部门投诉或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。特别是当用人单位未签订劳动合同或违法解除劳动合同时，劳动者有权要求用人单位支付相应的赔偿。
保留证据：
- 在整个过程中，劳动者应保留好相关证据（如工作证、工资条、考勤记录等），以便在需要时证明自己的劳动关系及用人单位的违法行为。
四、实际操作中的注意事项
- 工资结算：即使员工因旷工被认定为自动离职，用人单位也应按照法律规定结清员工在职期间的工资，不能随意克扣。
- 劳动仲裁：若劳动者认为用人单位的旷工离职规定不合理或不合法，可以通过劳动仲裁等方式维护自身权益。
示例说明：假设小李在某公司工作但未签订劳动合同，旷工三天后公司以自动离职为由扣了他半个月的工资。根据上述法律知识，公司扣除工资的行为可能不合理且违法。小李可以要求公司支付扣除的不合理部分工资，并且如果他入职已超过一个月，还能主张未签订劳动合同的二倍工资差额作为赔偿。
总结：旷工三天自动离职且没有劳动合同的行为，其合法性及后果需根据用人单位的规章制度、劳动合同的约定（尽管未签合同）、解除程序的合规性以及劳动者的具体情况和旷工原因来综合判断。用人单位在解除劳动合同时应谨慎行事，确保遵守相关法律法规和规章制度，维护劳动者的合法权益。劳动者在面对此类情况时，也应积极了解自己的权益并采取相应的措施来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。