结论：在缺乏直接证据的情况下，要证明农村书记安排人给河里喷除草剂导致村民菜地里菜死亡，确实存在一定难度，但并非完全无法维权。以下是从不同角度给出的分析和建议：
一、证据收集与固定
寻找间接证据：
- 证人证言：寻找当时在场或知晓此事的村民，询问他们是否看到或听到相关情况，并请他们出具书面证言或出庭作证。
- 现场痕迹：检查菜地及周边环境，看是否有除草剂残留、喷洒痕迹等，并拍照或录像固定证据。
- 专家意见：咨询农业专家或环保机构，了解除草剂对蔬菜生长的影响，以及是否可能因河里喷洒除草剂而导致菜地蔬菜死亡。
利用科技手段：
- 水质检测：对河里及菜地附近的水质进行检测，看是否含有除草剂成分，以及成分含量是否超标。
- 监控录像：如果村里或周边有监控摄像头，查看是否有相关记录，可能捕捉到喷洒除草剂的行为。
二、法律途径与维权策略
协商调解：
- 在证据收集过程中，可以尝试与农村书记或相关责任人进行协商，看是否能达成赔偿协议。
- 协商时，可以邀请村委会或乡镇政府等第三方机构参与，以增加协商的公正性和有效性。
行政投诉：
- 如果协商无果，可以向当地环保部门或农业部门投诉，要求他们介入调查并处理此事。
- 投诉时，应提供详细的证据材料，包括证人证言、现场照片、水质检测报告等。
民事诉讼：
- 如果行政投诉未能解决问题，可以考虑向法院提起民事诉讼，要求农村书记或相关责任人赔偿损失。
- 诉讼时，需要准备充分的证据材料，并可能需要聘请律师协助处理。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第一千二百二十九条：“因污染环境、破坏生态造成他人损害的，侵权人应当承担侵权责任。”以及第一千二百三十条：“因污染环境、破坏生态发生纠纷，行为人应当就法律规定的不承担责任或者减轻责任的情形及其行为与损害之间不存在因果关系承担举证责任。”这意味着，在环境污染侵权纠纷中，侵权人需要承担举证责任，证明其行为与损害之间不存在因果关系，否则将承担赔偿责任。
三、注意事项与风险提示
及时行动：
- 环境污染侵权纠纷的诉讼时效期间为三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。因此，应尽快采取行动，以免超过诉讼时效。
保留证据：
- 在整个维权过程中，应妥善保管所有证据材料，包括证人证言、现场照片、水质检测报告等，以备不时之需。
理性维权：
- 在维权过程中，应保持理性，避免采取过激行为或言语攻击等不当方式，以免给自己带来不必要的麻烦。
进一步思考：在处理此类环境污染侵权纠纷时，除了依法维权外，还可以考虑通过社区宣传、环保教育等方式提高村民的环保意识，共同维护良好的生态环境。同时，也可以推动相关部门加强对农村环境的监管力度，防止类似事件再次发生。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。