结论：当债务人因时效抗辩而免责，但保证人已经履行了债务时，保证人可以通过向债务人追偿来维护自己的权益。以下是对此问题的详细分析：
一、法律背景与原则
保证人的追偿权：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，保证人在承担保证责任后，有权向债务人追偿。这是保证人的一项基本权利，旨在平衡保证人与债务人之间的利益关系。
时效抗辩的影响：
- 债务人因时效抗辩而免责，意味着债权人无法再通过法律途径强制债务人履行债务。然而，这并不影响保证人已经承担的保证责任。保证人一旦履行了债务，就取得了对债务人的追偿权。
二、保证人追偿的具体操作
收集证据：
- 保证人需要收集相关证据，证明自己已经履行了保证责任，如支付凭证、债权人出具的收据等。这些证据是保证人向债务人追偿的基础。
与债务人协商：
- 在收集到足够证据后，保证人可以尝试与债务人进行协商，要求债务人偿还其已经履行的债务。如果债务人同意偿还，双方可以签订书面协议，明确偿还金额、时间等条款。
提起诉讼：
- 如果债务人拒绝偿还或协商无果，保证人可以向人民法院提起诉讼，要求债务人偿还其已经履行的债务。在诉讼过程中，保证人需要提交相关证据，证明自己的主张。
三、可能遇到的法律问题及建议
债务人无偿还能力：
- 如果债务人确实无偿还能力，保证人可能需要考虑通过其他途径来维护自己的权益，如申请债务人破产、参与债务人财产的分配等。然而，这些途径可能涉及复杂的法律程序和较高的成本，保证人需要谨慎考虑。
保证合同中的特别约定：
- 如果保证合同中有特别约定，如保证人放弃追偿权、追偿权的行使条件等，保证人需要仔细审查合同条款，确保自己的权益不受损害。如果合同条款存在歧义或不明确之处，保证人可以寻求法律援助或咨询专业律师。
四、实际操作中的注意事项
及时行使追偿权：
- 保证人在履行保证责任后，应及时行使追偿权，避免因时效问题而丧失追偿的权利。根据《中华人民共和国民法典》的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。
保留相关证据：
- 保证人在履行保证责任的过程中，应妥善保留相关证据，如支付凭证、债权人出具的收据、与债务人的沟通记录等。这些证据在后续追偿过程中将起到至关重要的作用。
建议：作为保证人，在履行保证责任后，务必及时行使追偿权，并妥善保留相关证据。如果遇到复杂的法律问题或债务人无偿还能力的情况，建议及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的权益。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。