在认定调解协议是否违反法律规定时，我们主要依据的是法律、行政法规的强制性规定以及调解协议所应遵循的基本原则。以下是对这一问题的详细解答：

首先，调解协议的内容必须严格遵守法律、行政法规的强制性规定。这是调解协议合法性的基础。如果调解协议中的任何条款与法律、行政法规相冲突，比如涉及非法买卖枪支、毒品等违法交易行为，那么这样的调解协议就是无效的，法院不会予以确认。

其次，调解协议不得损害国家利益或社会公共利益。调解协议应当维护国家和社会整体利益，如果协议内容涉及破坏国家重要资源、危害公共安全、损害社会公平正义等方面，那么法院将基于维护国家和社会整体利益的考虑，否定该调解协议的效力。

再者，调解协议应仅涉及协议双方当事人的权益，不得侵害案外人的合法权益。例如，在共有财产纠纷中，如果未经其他共有人同意就擅自处分共有财产，这样的调解协议将因损害其他共有人权益而不被法院认可。

此外，调解协议不应涉及是否追究当事人的刑事责任。刑事责任问题属于刑事法律关系的范畴，应通过司法程序解决，调解协议不能规避或替代刑事责任的追究。

同时，调解协议的内容必须符合社会公共秩序和善良风俗（即公序良俗）。如果调解协议以限制人身自由、违背婚姻自由原则等为内容，那么这样的协议将因违背公序良俗而不能得到法院的确认。

另外，调解应遵循自愿原则。如果调解协议是在欺诈、胁迫、重大误解、显失公平等情形下达成的，导致当事人意思表示不真实，那么法院将不会确认该调解协议。

还有，调解协议的内容必须明确具体，具有可履行性。如果协议内容模糊不清，权利义务关系不明确，或者各方当事人对协议的理解存在重大分歧，且无法通过合理方式确定具体履行内容，那么法院将不予确认该调解协议。

最后，除了上述情形外，如果调解协议存在其他违法或不当情形，比如调解组织、调解员强迫调解、与案件有利害关系等，也可能导致法院不予确认其效力。但需要注意的是，如果当事人明知存在上述情形仍坚持申请确认，那么法院可能会根据具体情况进行判断。

综上所述，当事人在签订调解协议时，应确保协议内容合法、合规，遵循自愿、公平、诚实信用的原则，并明确具体的权利义务关系，以确保调解协议的有效性和可执行性。如果调解协议存在违反法律规定的情形，那么法院将不会予以确认其效力。