结论：在确是被告签名但被告不认可，且笔迹鉴定因时间太久不通过的情况下，可以通过收集其他证据来证明签名的真实性，或者考虑通过其他法律途径来维护自身权益。以下是一些具体的分析和建议：
一、收集其他证据证明签名真实性
证人证言：
- 如果当时有目击者在场，可以寻找这些目击者作为证人，让他们出庭作证，证明被告确实在合同上签了名。
- 证人证言在法律上具有一定的证明力，尤其是当证人能够清晰、准确地描述签名过程时。
视频或音频资料：
- 如果当时有拍摄视频或录音，且视频或音频中能够清晰地听到或看到被告签名的过程，那么这些资料可以作为强有力的证据。
- 视频或音频资料具有直观性和客观性，往往能够直接证明签名的真实性。
其他相关证据：
- 例如，如果合同是在某个特定场合签订的，且该场合有监控录像，可以尝试获取这些监控录像作为证据。
- 或者，如果被告在签订合同后有过与合同内容相关的行为或言论，这些也可以作为间接证据来证明签名的真实性。
二、考虑其他法律途径
申请重新鉴定：
- 虽然笔迹鉴定因时间太久不通过，但并不意味着完全无法进行鉴定。可以尝试寻找更专业的鉴定机构或专家，看是否能够进行更精确的鉴定。
- 或者，如果能够提供被告在其他时间、地点的签名样本，可能有助于鉴定机构进行更准确的比对和鉴定。
利用法律推定：
- 在某些情况下，法律会规定一些推定规则。例如，如果合同上有被告的签名，且被告无法提供合理的解释或证据来反驳签名的真实性，那么法律可能会推定该签名为被告所签。
- 当然，这种推定并不是绝对的，需要结合其他证据和案件具体情况来综合判断。
寻求调解或仲裁：
- 如果双方对签名的真实性存在争议，且无法通过证据来证明，可以考虑寻求调解或仲裁来解决纠纷。
- 调解或仲裁机构会根据双方提供的证据和陈述，以及相关法律法规和行业惯例，来做出公正的裁决或调解协议。
三、注意事项
及时收集证据：
- 在发现笔迹鉴定不通过后，应尽快收集其他证据来证明签名的真实性。时间拖得越久，证据可能越难以获取或保存。
咨询专业律师：
- 在处理这类纠纷时，建议咨询专业律师的意见。律师可以根据案件具体情况和法律法规，为你提供更具体、更专业的建议和指导。不过，既然你已经在向我咨询，我会尽我所能为你提供帮助。
保持冷静和理性：
- 在处理纠纷时，保持冷静和理性是非常重要的。不要因为情绪激动而做出一些不理智的行为或决策，这可能会对你的权益造成更大的损害。
进一步思考：在处理这类合同纠纷时，除了关注签名的真实性外，还需要关注合同的其他条款和内容是否合法、有效。如果合同本身存在违法或无效的情况，那么即使签名是真实的，也可能无法维护你的权益。因此，在处理纠纷时，应全面、综合地考虑各种因素。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。