结论：与总公司签订的合同，是否可以向分公司付款，需根据合同具体约定、分公司授权情况及法律规定综合判断。以下从不同角度详细分析：

一、合同约定优先

1. 合同明确约定付款对象：若合同中明确约定了付款对象为总公司，则原则上应按照合同约定向总公司付款。此时，若未经总公司同意，擅自向分公司付款，可能构成违约，总公司有权要求继续履行合同或承担违约责任。

2. 合同未明确约定付款对象：若合同中未明确约定付款对象，或约定为“甲方（总公司）或其指定方”，则存在向分公司付款的可能性。但在此情况下，仍需确保分公司已获得总公司的明确授权，且该授权在付款时仍然有效。

二、分公司授权情况

1. 分公司获得总公司明确授权：若分公司已获得总公司的书面或口头授权，可以代表总公司接收款项，则向分公司付款是合法的。但为避免纠纷，建议要求分公司提供总公司的授权书或相关证明文件。

2. 分公司未获得总公司授权：若分公司未获得总公司的明确授权，擅自接收款项，则可能构成无权代理。此时，总公司有权拒绝承认该付款行为，并要求付款方重新向总公司付款。若因此给总公司造成损失的，分公司还可能需承担赔偿责任。

三、法律规定及实践

1. 法律规定：根据《中华人民共和国公司法》及相关法律法规，分公司不具有法人资格，其民事责任由总公司承担。但这并不意味着分公司不能作为合同的一方或接收款项的主体，关键在于是否获得总公司的授权。

2. 实践操作：在实际操作中，为确保付款的合法性和有效性，建议采取以下措施：

   • 在合同中明确约定付款对象、付款方式及付款账户等信息；
   • 若需向分公司付款，要求分公司提供总公司的授权书或相关证明文件；
   • 付款后，要求收款方（无论是总公司还是分公司）出具收款确认书或发票等证明文件；
   • 保留好所有与付款相关的证据材料，以备不时之需。

四、可能的风险及防范

1. 风险：若未经总公司同意擅自向分公司付款，可能面临以下风险：

   • 总公司拒绝承认该付款行为，要求重新付款；
   • 因分公司未获得授权而构成无权代理，需承担违约责任或赔偿责任；
   • 付款后无法获得有效的收款证明文件，导致财务处理困难或引发税务风险。

2. 防范：为防范上述风险，建议采取以下措施：

   • 在付款前与总公司进行充分沟通，确认付款对象及付款方式；
   • 要求收款方提供有效的授权文件或证明文件；
   • 付款后及时索取收款确认书或发票等证明文件；
   • 定期对付款情况进行核对和清理，确保账实相符。

总结与建议：与总公司签订的合同是否可以向分公司付款，需根据合同约定、分公司授权情况及法律规定综合判断。为确保付款的合法性和有效性，建议在付款前与总公司进行充分沟通并确认相关事项。若您在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。