结论：招商引资项目要求企业以违约金形式补缴差额税收，这一做法的合法性需根据具体情况来判断，但在多数情况下，这种做法可能涉嫌违法。以下从多个角度进行分析：

一、税收法定原则

根据税收法定原则，税收的征收必须依据法律的规定进行，包括税种的设立、税率的确定以及税收的征收管理等。如果招商引资项目中要求企业以违约金形式补缴差额税收，这实际上是在法律规定的税收之外，额外增加了企业的负担。这种做法可能违反了税收法定原则，因为违约金并非法律规定的税收种类。

二、合同自由与公平原则

在招商引资项目中，政府与企业之间通常会签订投资合同或协议。根据合同自由原则，双方有权在合同中约定各自的权利和义务。然而，合同的内容必须遵循公平原则，不得损害国家、集体或第三人的利益，也不得违反法律、行政法规的强制性规定。如果合同中约定企业需以违约金形式补缴差额税收，且这种约定违反了税收法定原则或显失公平，那么该约定可能被认定为无效。

三、具体情形分析

1. 若差额税收是由于企业未履行合同中的税收缴纳义务导致的：

   • 在这种情况下，政府可以依据合同约定或相关法律法规，要求企业补缴税款及可能产生的滞纳金或罚款。但这里的滞纳金或罚款应明确为法律规定的种类，而非以“违约金”的形式出现。

2. 若差额税收并非由于企业未履行税收缴纳义务，而是政府单方面要求企业补缴的：

   • 这种做法可能缺乏法律依据，且可能构成对企业的不公平对待。企业有权拒绝这种无理要求，并可以通过法律途径维护自己的合法权益。

四、法律建议

1. 对于企业而言：

   • 在签订招商引资合同时，应仔细审查合同条款，特别是关于税收缴纳和违约金的部分。确保合同内容合法合规，避免陷入不必要的法律纠纷。
   • 如果遇到政府要求以违约金形式补缴差额税收的情况，企业应首先咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及可能的法律后果。

2. 对于政府而言：

   • 在招商引资过程中，应遵循税收法定原则和合同自由与公平原则，不得随意增加企业的税收负担。
   • 如果需要企业补缴税款，应依据相关法律法规进行，并明确告知企业补缴的原因、金额和方式等。

最后，招商引资项目要求企业以违约金形式补缴差额税收的做法，在多数情况下可能涉嫌违法。企业在遇到此类情况时，应及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，并依法维护自己的合法权益。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。