结论：投资合作款改为借款在双方自愿、真实意思表示，且不违反法律法规和程序要求的前提下是合法的。但这一转化过程需严格遵守法律规定，确保不损害第三方利益，并遵循一定的程序和要求。
一、合法性基础与条件
合同自由原则：
- 根据《中华人民共和国民法典》，民事主体有权依法自愿订立或变更合同。因此，将投资合作款转化为借款，作为对原合同的变更或新合同的订立，在法律上是允许的。
双方协商一致：
- 必须确保投资人和接受投资的一方经过平等、自愿的协商，明确达成将投资合作款转变为借款的合意。这一过程中，不存在欺诈、胁迫、重大误解等影响意思表示真实性的情形是关键。
合法性要求：
- 转化行为必须符合法律、行政法规的强制性规定，不得违背公序良俗。例如，转化后的借款利率不得超过法律允许的范围，否则可能被视为高利贷而无效。
不损害第三方利益：
- 转化行为不能损害公司债权人、其他股东等第三方的合法权益。如果转化行为导致公司资产减少，进而损害债权人的利益，那么这一转化行为可能被认定为无效。
二、变更程序与资金性质调整
变更程序：
- 若涉及公司等主体，投资合作款变更为借款可能需要遵循一定的内部决策程序。例如，在有限责任公司中，可能需要股东会的审议和批准。未按规定程序进行可能导致变更行为效力存在瑕疵。
资金性质实质变更：
- 投资和借款在法律性质上有明显区别。转化为借款后，双方的权利义务关系需按照借款模式调整。这包括明确还款期限、利息等条款，以及投资人角色的转变（从投资者变为债权人）。
三、借款合同内容与证据保留
借款合同内容：
- 转化后的借款合同应详细列明借款金额、利率、还款期限等关键条款。这些条款应合理且符合法律规定，特别是借款利率不得超过法律允许的范围。
证据保留：
- 在转化过程中，双方应妥善保留书面协议、转账记录等相关证据。这些证据在发生纠纷时能够证明借贷关系的存在和合法性，是维护双方权益的重要依据。
四、风险与应对建议
法律风险：
- 若转化行为不符合法律规定或程序要求，可能面临合同无效、承担违约责任等法律风险。例如，如果转化行为被认定为高利贷，那么超出法律允许范围的利息部分将不受法律保护。
应对建议：
- 在进行此类操作前，建议双方务必充分了解相关法律法规和程序要求，确保行为的合法性和合规性。
- 如果在操作过程中遇到疑问或纠纷，应及时向我咨询，通过合法途径解决争议，避免损失扩大。
举例说明：假设甲和乙共同投资设立了一家公司，甲投入了100万元作为投资款。后来，由于各种原因，甲希望将这笔投资款转化为借款。在这种情况下，甲和乙需要经过平等、自愿的协商，明确达成将投资款转变为借款的合意，并签订详细的借款合同。同时，他们还需要确保这一转化行为不损害公司债权人的利益，并遵循公司内部的决策程序（如股东会审议和批准）。如果一切顺利，甲就可以按照借款合同的约定向乙收取利息和本金了。
总之，投资合作款改为借款是一个复杂的过程，需要双方充分了解相关法律法规和程序要求，并谨慎行事。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。