在农村建房过程中与工人发生冲突且案件未结的情况下，能否继续施工需分情况讨论：

1. 若冲突未引发法律纠纷或行政干预
   若冲突仅限于双方口头争执、肢体轻微推搡等未构成治安或刑事案件的情形，且未引发劳动监察、住建部门等行政机关介入调查或下达停工通知，理论上可以继续施工。但需注意：

   • 需确保工人情绪稳定，避免冲突升级引发更大纠纷；
     
   • 建议通过书面协议明确双方权利义务（如工资支付、工期要求等），降低后续争议风险。

2. 若冲突已引发法律程序或行政干预

   • 治安/刑事案件：若冲突导致工人受伤（经鉴定构成轻伤及以上）或涉及故意毁坏财物等行为，公安机关立案后可能根据《治安管理处罚法》或《刑法》采取强制措施（如拘留、逮捕），同时可能要求现场保全证据或暂停施工以配合调查。此时继续施工可能构成妨碍公务或证据灭失，需立即停止。
     
   • 劳动争议仲裁/诉讼：若工人以欠薪、工伤等为由申请劳动仲裁或提起诉讼，仲裁机构或法院可能根据《劳动争议调解仲裁法》或《民事诉讼法》裁定“先予执行”或“财产保全”，要求暂停施工直至纠纷解决。此时需以仲裁/法院通知为准。
     
   • 行政处罚停工：若住建部门因冲突认定施工存在安全隐患（如工人情绪波动导致操作失误风险）或违反《建筑法》关于“文明施工”的规定，可能下达《停工整改通知书》，此时必须停工直至整改验收合格。

3. 实务建议

   • 优先协商：通过村委会、派出所等第三方调解，尽快与工人达成和解（如签订和解协议、支付合理补偿），避免纠纷扩大化；
     
   • 固定证据：若冲突涉及人身伤害或财产损失，及时拍照、录像、保存医疗记录等证据，为后续法律程序做准备；
     
   • 合规施工：确保施工手续齐全（如宅基地证、施工许可证），避免因程序瑕疵被行政机关抓到“把柄”而停工；
     
   • 法律风险评估：若冲突复杂（如涉及多人、跨地区），建议委托律师分析案件走向，制定“继续施工”或“暂停施工”的最优策略。

总结：能否继续施工需结合冲突性质、法律程序进展、行政干预情况综合判断。若冲突已进入法律或行政程序，强行施工可能面临更严厉处罚；若仅为普通纠纷，可通过协商、合规操作降低风险。具体操作可进一步向我咨询，我会结合您所在地区的司法实践给出更精准的建议。