停职检查期间是否扣工资，需根据停职原因、公司规章制度及法律法规综合判断。以下从不同角度详细分析：

一、因劳动者个人原因停职

1. 涉嫌违法违纪被停职

   • 处理原则：若劳动者因涉嫌违法违纪被停职检查，用人单位通常会按劳动合同约定支付工资。但若劳动者行为给公司造成损失，用人单位可要求其赔偿，赔偿额可从工资中扣除。不过，每月扣除部分不得超过工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。
   • 实例说明：如员工因涉嫌商业贿赂被停职，月工资8000元，则公司每月最多可扣除1600元作为赔偿，剩余6400元需支付给员工。

2. 不胜任工作被停职培训

   • 处理原则：若劳动者因不胜任工作而被安排停职培训，用人单位应按正常出勤支付工资。因为这是为提升劳动者能力而采取的措施，非劳动者主观过错。
   • 实例说明：如员工因业务能力不足被安排停职培训一个月，期间公司应按其正常工作时的工资标准发放工资，不得扣减。

二、因公司原因停职

• 处理原则：非因劳动者原因（如公司经营调整）导致停工、停产，在一个工资支付周期内，用人单位应按劳动合同规定支付工资；超过一个周期，若劳动者提供正常劳动，则支付的劳动报酬不得低于当地最低工资标准；若未提供正常劳动，应按国家有关规定办理，通常不低于当地最低工资标准的一定比例支付生活费。
• 法律依据：根据《工资支付暂行规定》第十二条，非因劳动者原因造成单位停工、停产在一个工资支付周期内的，用人单位应按劳动合同规定的标准支付劳动者工资。超过一个工资支付周期的，若劳动者提供了正常劳动，则支付给劳动者的劳动报酬不得低于当地的最低工资标准；若劳动者没有提供正常劳动，应按国家有关规定办理。

三、公司内部规定与劳动合同的作用

1. 内部规定：若公司有明确的关于停职期间工资待遇的内部规定，且不违反国家强制性法律规定，则应按照这些规定执行。例如，公司可能规定停职期间支付基本工资的80%等。
2. 劳动合同：若内部规定不明确或没有相关规定，应参考劳动合同中的相关条款来执行。劳动合同中通常会明确约定员工的工资待遇、支付方式及时间等内容。
3. 法律法规：若内部规定和劳动合同中均无明确规定，则应依据《中华人民共和国劳动法》等相关法律法规来处理，确保按时足额支付劳动者工资，不得无故拖欠或扣减。

四、建议与注意事项

• 了解公司规定：劳动者在停职前应了解公司的相关规定，以便在停职期间明确自己的权益。
• 保留证据：若公司存在无故拖欠或扣减工资的行为，劳动者应保留相关证据，如工资条、停职通知等，以便后续维权。
• 及时沟通：若对停职期间的工资待遇有疑问或不满，劳动者应及时与公司沟通，寻求解决方案。

总结来说，停职检查期间是否扣工资并非绝对，而是取决于停职原因、公司规章制度及法律法规的综合判断。劳动者在遇到此类情况时，应了解自己的权益并保留相关证据，以便在必要时维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。