结论：甲方配送到乙方指定地点，并不能直接说明运输费是由甲方承担的，运输费的承担方需根据合同中的具体约定或交易习惯来确定。
分析说明：
合同约定优先：
- 在合同纠纷中，合同的具体条款是判断双方权利义务的首要依据。如果合同中明确规定了运输费的承担方，那么无论甲方配送到何处，都应按照合同约定执行。例如，合同中可能明确写着“运输费由甲方承担”或“运输费由乙方承担”，这样的条款将直接决定运输费的支付责任。
交易习惯的影响：
- 如果合同中没有明确约定运输费的承担方，那么可以考虑交易习惯。在某些行业或地区，可能存在普遍的交易习惯，即由哪一方承担运输费。如果双方长期合作且一直遵循某种交易习惯，那么在没有明确合同约定的情况下，可以参照该交易习惯来判断。但需要注意的是，交易习惯应当具有普遍性和稳定性，且双方应当对此有明确的认知和接受。
法律原则的应用：
- 在缺乏合同约定和交易习惯的情况下，可以依据法律原则进行推断。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人应当遵循公平原则、诚实信用原则等来确定各自的权利义务。如果甲方配送到乙方指定地点是合同履行的一部分，且没有额外约定运输费的承担方，那么双方可以协商确定运输费的支付责任。如果协商不成，可以依据法律原则或相关司法解释进行裁决。
法律建议：
- 审查合同条款：首先，双方应仔细审查合同中的相关条款，特别是关于运输费承担的部分。如果合同中有明确约定，则按照约定执行。
- 协商解决：如果合同中没有明确约定或约定不明确，双方可以尝试通过协商来解决运输费的承担问题。协商时可以考虑交易习惯、行业惯例以及双方的实际情况等因素。
- 寻求法律途径：如果协商不成，双方可以寻求法律途径来解决争议。可以向人民法院提起诉讼或申请仲裁机构进行仲裁，由法院或仲裁机构根据合同约定、交易习惯以及法律原则等作出裁决。
后续行动建议：
- 在未来的合同签订中，建议双方明确约定运输费的承担方以及相关的支付方式和时间等条款，以避免类似的争议发生。
- 如果双方已经存在争议且无法协商解决，建议及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议和帮助。
如有任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问，我会根据你的具体情况提供详细的法律解答。