招标代理费可以由甲方支付，但需根据具体情况和合同约定来确定。以下从不同角度进行分析：

1. 法律法规层面
   根据《中华人民共和国招标投标法》及相关实施条例，招标代理费的支付主体并未被明确限定为招标人（甲方）或中标人，而是允许双方通过合同约定。因此，只要合同条款不违反法律强制性规定，甲方支付代理费是合法的。例如，若招标文件中明确约定“代理费由甲方承担”，或甲乙双方在委托合同中达成一致，则甲方支付具有法律效力。

2. 合同约定优先原则
   招标代理合同属于民事委托合同，根据《民法典》第九百二十八条，受托人完成委托事务后，委托人应按约定支付报酬。因此：

   • 若合同明确约定代理费由甲方支付，则甲方需履行支付义务；
     
   • 若合同约定由中标人支付（常见于政府采购项目），则甲方无需直接承担，但需确保中标人按约定支付，否则可能需承担连带责任；
     
   • 若合同未约定或约定模糊，可能引发纠纷，此时需结合行业惯例、双方交易目的等综合判断。

3. 行业惯例与实际操作
   在工程建设、货物采购等领域，代理费支付主体可能因项目性质不同而有所差异：

   • 甲方支付：常见于甲方主导的招标项目，或甲方为规避中标人拒付风险而主动承担；
     
   • 中标人支付：多见于政府采购项目，依据《政府采购法实施条例》第十七条，采购人（甲方）可在招标文件中约定中标人支付代理费，但需在预算中单独列明，不得转嫁为采购成本。

4. 风险提示与建议

   • 甲方支付时：需在合同中明确代理费金额、支付时间及条件，避免因费用争议影响项目进度；
     
   • 中标人支付时：甲方应监督中标人按时支付，并在合同中约定违约责任（如扣留履约保证金等）；
     
   • 无约定时：建议双方协商补充协议，或参考行业惯例（如工程建设领域多由甲方支付）处理。

总结：招标代理费的支付主体需以合同约定为准，法律法规未强制限制甲方支付。若您遇到具体纠纷或需起草/审查合同，可直接向我咨询，我会结合项目细节提供针对性建议。