结论：公司以您上9个小时班就认定早退的行为是否合法，需结合公司规章制度、劳动合同以及实际工作安排来判断。若公司规章制度或劳动合同中未明确规定每日工作时间为12小时，且未提供合理的工作安排或调休方案，则公司认定您早退可能缺乏合法依据。

详细分析：

1. 公司规章制度与劳动合同的约定：

   • 首先，您需要查看公司的规章制度以及您与公司签订的劳动合同中，是否有关于每日工作时间的明确规定。如果合同或制度中明确规定了每日工作时间为12小时，且您未按照此规定工作，公司可能有权依据规章制度对您进行相应处理。
   • 然而，如果合同或制度中并未明确规定每日工作时间，或者规定的工作时间与实际安排不符，公司则不能单方面以您未工作满12小时为由认定您早退。

2. 实际工作安排与调休：

   • 即便公司规章制度或劳动合同中规定了每日工作时间为12小时，公司也需要考虑实际工作安排和调休情况。如果公司因业务需求或其他原因，临时调整了您的工作时间，且未提前通知您或未提供合理的调休方案，那么公司以您未工作满12小时为由认定早退也是不合理的。
   • 另外，如果公司要求您连续工作12小时，这可能涉及到加班问题。根据《中华人民共和国劳动法》的规定，用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，一般每日不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。如果公司未按照法律规定支付加班费或未获得您的同意就安排加班，这也是违法的。

3. 您的应对策略：

   • 与公司沟通：首先，您可以尝试与公司的人力资源部门或上级领导进行沟通，了解公司认定您早退的具体原因和依据，并表达您的观点和困惑。
   • 收集证据：如果公司坚持认定您早退，您可以开始收集相关证据，如工作记录、考勤记录、与同事的沟通记录等，以证明您并未早退或公司存在不合理的工作安排。
   • 申请劳动仲裁：如果与公司沟通无果，您可以向当地的劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，要求公司撤销对您早退的认定，并可能要求公司支付相应的经济补偿或赔偿金。

法律建议：

• 在处理此类问题时，建议您保持冷静和理性，避免与公司发生不必要的冲突。
• 及时收集并保存相关证据，以便在需要时证明自己的权益。
• 如果对劳动法律法规不熟悉，可以寻求专业律师的帮助，以确保您的权益得到充分保护。

可能后果：

• 如果公司认定您早退的行为缺乏合法依据，且您能够提供充分证据证明自己的权益，那么您有可能通过劳动仲裁或诉讼等途径维护自己的合法权益。
• 如果公司认定您早退的行为有合法依据，且您无法提供充分证据反驳，那么您可能需要接受公司的相应处理，如扣减工资、警告等。但即便如此，公司也需要确保处理过程合法合规，不得侵犯您的合法权益。