公司对工伤员工进行考核是否合法，不能一概而论，需要分情况讨论：
一、合法情形
考核内容与工伤无关：
- 如果公司对工伤员工的考核内容仅涉及与工伤无关的工作表现、工作态度、团队协作能力等方面，且考核标准公平、公正、公开，那么这种考核是合法的。因为公司有权对员工的工作表现进行管理和评价，以促进员工的工作积极性和工作效率。
工伤员工已恢复工作能力：
- 如果工伤员工经过治疗后已经恢复工作能力，且能够胜任原工作或公司安排的其他工作，那么公司对其进行正常的考核也是合法的。这有助于确保员工的工作质量和效率，同时也有助于维护公司的正常运营秩序。
二、不合法情形
考核内容与工伤直接相关：
- 如果公司对工伤员工的考核内容直接涉及工伤造成的身体损伤或功能障碍，如要求工伤员工完成与工伤前相同的工作任务或达到相同的绩效标准，那么这种考核是不合法的。因为工伤员工在工伤期间可能无法完全恢复工作能力，对其提出过高的要求是不公平的，也可能违反相关法律法规的规定。
工伤员工处于停工留薪期或医疗期内：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，工伤员工在停工留薪期或医疗期内享有相应的医疗和休息权利，公司不得安排其从事工作或进行考核。如果公司在此期间对工伤员工进行考核，并据此作出不利于员工的决定（如降薪、解雇等），那么这种行为是不合法的。
考核标准不公平或存在歧视：
- 如果公司对工伤员工的考核标准不公平或存在歧视性条款，如故意降低工伤员工的绩效评分、设置不合理的考核指标等，那么这种考核也是不合法的。因为这违反了公平、公正、公开的原则，也可能侵犯工伤员工的合法权益。
三、法律建议
公司应制定合理的考核制度：
- 公司应制定公平、公正、公开的考核制度，明确考核标准、考核程序和考核结果的应用方式。在考核工伤员工时，应充分考虑其工伤情况和恢复能力，避免提出不切实际的要求。
工伤员工应了解自己的权益：
- 工伤员工应了解自己的权益和法律法规的规定，如停工留薪期、医疗期、工伤赔偿等。如果公司对其进行不合理的考核或作出不利于自己的决定，工伤员工有权向相关部门投诉或寻求法律援助。
双方应加强沟通和协商：
- 公司和工伤员工之间应加强沟通和协商，共同解决考核过程中出现的问题。如果双方无法达成一致意见，可以寻求第三方调解或仲裁机构的帮助。
如果公司对工伤员工进行不合理的考核或作出不利于自己的决定，工伤员工有权依法维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。