就业协议盖了小微企业的章，在一般情况下是有效的。以下从多个角度为你详细分析：

协议有效性基础

就业协议，作为劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议，其有效性主要取决于协议内容是否合法、双方意思表示是否真实以及是否符合法律规定的形式要求。小微企业作为用人单位的一种，其盖章行为在符合法律规定的情况下，能够代表企业的真实意思表示，因此，就业协议上加盖小微企业的公章，通常是有效的。

盖章的具体要求

1. 公章的真实性：首先，必须确保所盖的公章是小微企业真实有效的公章，而非伪造或冒用的。如果公章是伪造的，那么该就业协议自然无效，且可能涉及法律责任。

2. 盖章人的权限：其次，盖章人必须具有代表小微企业签订就业协议的权限。这通常要求盖章人是企业的法定代表人、授权代表或具有相应权限的管理人员。如果盖章人没有相应的权限，那么该盖章行为可能构成无权代理，影响协议的效力。不过，如果事后得到了企业的追认，那么该协议仍然可以视为有效。

3. 协议内容的合法性：除了盖章的真实性和权限外，就业协议的内容也必须合法。如果协议内容违反了法律、行政法规的强制性规定，或者违背了公序良俗，那么该协议将无效。例如，协议中约定了违反劳动法的条款，如超长工作时间、低于最低工资标准的薪酬等，这些条款都是无效的。

特殊情况下的效力问题

1. 小微企业未注册或注销：如果小微企业在签订就业协议时尚未注册成立，或者已经注销，那么该协议可能因主体不适格而无效。因为此时的企业并不具备法律上的主体资格，无法承担协议中的权利和义务。

2. 协议存在欺诈、胁迫等情形：如果就业协议是在欺诈、胁迫等情形下签订的，那么受欺诈或胁迫的一方有权请求人民法院或者仲裁机构撤销该协议。撤销后，该协议自始无效。

法律建议

1. 核实企业信息：在签订就业协议前，建议劳动者核实小微企业的注册信息、经营状况等，确保企业具备签订协议的主体资格。

2. 审查协议内容：仔细审查就业协议的内容，确保条款合法、合理，并明确双方的权利和义务。如有疑问，可咨询专业律师。

3. 保留证据：在签订和履行就业协议过程中，注意保留相关证据，如协议文本、沟通记录、工资支付凭证等，以备不时之需。

如果你在就业协议签订或履行过程中遇到任何法律问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议和帮助。