面对您提出的“自己做了伤残鉴定保险公司不认，但法院为什么同意申请重新做伤残鉴定”的问题，这确实是一个涉及保险理赔和法律程序的重要议题。以下是我为您详细梳理的解答：

一、保险公司不认伤残鉴定的可能原因

1. 鉴定机构资质问题：保险公司可能对您选择的鉴定机构资质存在质疑，认为其不具备进行伤残鉴定的合法资格。
2. 鉴定程序不合规：保险公司可能认为鉴定过程中存在程序瑕疵，如鉴定人员资质不符、鉴定材料不完整或真实性存疑等。
3. 鉴定标准不一致：保险公司可能采用与您所选鉴定机构不同的伤残鉴定标准，导致对鉴定结果产生分歧。

二、法院同意重新做伤残鉴定的原因

1. 确保公正性：法院作为中立的第三方，为了确保伤残鉴定的公正性和客观性，可能会同意重新进行鉴定，以消除双方对原鉴定结果的疑虑。
2. 法律程序要求：在保险理赔纠纷中，如果双方对伤残鉴定结果存在争议，且无法通过协商解决，法院通常会根据法律程序要求，委托具有合法资质的鉴定机构进行重新鉴定。
3. 证据充分性：法院在审理案件时，会综合考虑双方提供的证据。如果原伤残鉴定报告存在瑕疵或不足以支持您的主张，法院可能会同意重新鉴定以获取更充分的证据。

三、重新做伤残鉴定的流程与注意事项

1. 选择鉴定机构：在法院同意重新鉴定后，您需要与保险公司共同选择或由法院指定一家具有合法资质的鉴定机构进行鉴定。
2. 准备鉴定材料：您需要准备完整的医疗记录、诊断证明、影像资料等相关材料，以确保鉴定过程的顺利进行。
3. 遵守鉴定程序：在鉴定过程中，您需要遵守鉴定机构的程序要求，如按时参加鉴定、配合鉴定人员的工作等。
4. 保留证据：在整个过程中，务必保留好所有相关的证据和材料，如鉴定申请书、鉴定报告、沟通记录等，以便在需要时提供充分证明。

四、后续建议

1. 与保险公司保持沟通：在重新鉴定过程中，与保险公司保持积极沟通，了解其意见和要求，以便更好地配合鉴定工作。
2. 寻求法律援助：如果您对法律程序或鉴定过程存在疑问，可以考虑聘请专业律师提供法律援助和代理服务，以提高问题解决的专业性和效率。

综上所述，法院同意重新做伤残鉴定是为了确保公正性、满足法律程序要求以及获取更充分的证据。在重新鉴定过程中，您需要选择合法资质的鉴定机构、准备完整的鉴定材料、遵守鉴定程序，并保留好所有相关证据。如有必要，可寻求法律援助以更好地维护自身权益。