结论：九十年代企业为自己单位职工建房是否违法，不能一概而论，需结合当时的具体法律法规、政策以及建房的具体情况来判断。以下从不同角度进行分析：
法律法规与政策角度：
- 在九十年代，我国对于单位自建房并没有普遍性的禁止性规定。单位自建房是否违法，主要取决于当时当地的土地管理、城乡规划、住房分配等相关法律法规和政策。
- 如果企业建房行为符合当时当地的土地使用规划、城乡规划，且获得了相关政府部门的批准和许可，同时住房分配也遵循了公平、公正的原则，那么这种建房行为通常是合法的。
- 反之，如果企业未经批准擅自占用土地建房，或者违反了当时的住房分配政策，如将住房分配给不符合条件的职工，那么这种建房行为就可能构成违法。
建房资金与来源角度：
- 如果企业使用自有资金为职工建房，且资金来源合法，没有涉及挪用公款、贪污等违法行为，那么这种建房行为在资金层面通常是合法的。
- 如果企业建房资金来源不明，或者存在挪用、贪污等违法行为，那么这种建房行为就可能因资金问题而构成违法。
建房用途与分配角度：
- 如果企业建房的目的是为了解决职工的住房问题，且住房分配遵循了公平、公正的原则，如按照职工的工龄、职位、贡献等因素进行分配，那么这种建房行为在用途和分配层面通常是合法的。
- 如果企业建房的目的是为了谋取私利，如将住房出售给非职工人员或者以高价出租给职工，那么这种建房行为就可能因用途和分配问题而构成违法。
法律建议：
- 对于九十年代企业为自己单位职工建房的行为，如果现在存在争议或纠纷，建议首先查阅当时的法律法规和政策文件，了解建房行为是否符合当时的规定。
- 同时，收集建房过程中的相关证据，如政府部门的批准文件、资金来源证明、住房分配方案等，以便在争议或纠纷中证明建房行为的合法性。
- 如果建房行为确实存在违法问题，建议及时与相关部门沟通协商，寻求妥善的解决方案，避免法律纠纷的进一步升级。
可能法律后果：
- 如果建房行为被认定为违法，企业可能面临行政处罚，如罚款、没收违法所得等。
- 在严重情况下，如果建房行为涉及贪污、挪用公款等犯罪行为，相关责任人还可能面临刑事责任的追究。
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