国企员工违法所得全部退回后，处理方式需结合具体违法情形、法律规定及企业内部制度综合判断，通常涉及行政处分、刑事责任追究及企业合规整改等环节。以下从不同角度展开分析：

1. 行政处分层面：依据企业内部规定与《劳动法》处理

• 违法所得退回的性质：员工主动退回违法所得，属于“事后补救行为”，但无法完全消除违法行为的性质。企业仍需根据内部规章制度（如《员工违纪处理办法》）及《劳动合同法》第39条，对员工行为进行定性。
• 常见处分类型：
  • 警告、记过：适用于违法情节较轻、未造成严重后果的情形（如违规报销小额费用）；
  • 降级、撤职：若违法行为涉及职务便利（如贪污、受贿），且金额较大，可能面临职务调整；
  • 解除劳动合同：若违法行为构成“严重违反用人单位规章制度”或“被依法追究刑事责任”，企业可单方解约且无需支付补偿金。
• 程序要求：企业需依法履行调查、告知、听取申辩等程序，确保处分决定合法合规。

2. 刑事责任层面：退回违法所得不影响定罪，但可能影响量刑

• 定罪标准：违法所得是否退回，不影响犯罪构成的成立。例如，贪污罪、受贿罪的成立以“利用职务便利非法占有财物”为核心要件，退回赃款仅能作为量刑情节。
• 量刑影响：根据《刑法》及相关司法解释，主动退赃可视为“认罪悔罪表现”，法院可能酌情从轻或减轻处罚（如降低基准刑30%以下）。但若违法行为已构成“数额巨大”或“情节特别严重”，退赃可能仅影响刑期长短，而非免除刑事责任。
• 例外情形：若违法行为未达到刑事立案标准（如贪污3万元以下），退回违法所得后，企业可能仅作行政处分，无需移送司法机关。

3. 企业合规层面：需同步完善内部治理机制

• 追责与整改并重：企业除对涉事员工处分外，还需排查管理漏洞（如财务审批流程、权力监督机制），避免同类事件再次发生。
• 合规体系建设：建议企业依据《中央企业合规管理办法》等规定，建立“违法所得追缴、责任追究、制度修复”的全流程机制，例如明确退赃程序、设立合规监督岗位等。
• 声誉风险管理：若违法行为涉及公众利益（如国有资产流失），企业需通过公开说明、整改报告等方式修复社会形象，降低负面影响。

4. 实务建议：分阶段处理更稳妥

• 调查阶段：企业应第一时间固定证据（如财务记录、沟通记录），避免证据灭失；
• 处分阶段：根据违法情节轻重，选择匹配的处分措施，并留存书面记录；
• 移送阶段：若涉嫌犯罪，企业需在处分后及时向监察机关或公安机关报案，并配合调查；
• 善后阶段：通过培训、审计等方式强化合规意识，形成长效机制。

总结：国企员工退回违法所得后，企业需从行政处分、刑事责任、合规整改三方面综合处理，既要依法追责，也要通过制度完善防范风险。具体操作中，建议结合违法行为性质、金额大小及企业制度，制定个性化方案。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体场景下的处理策略。