宅基地上建二层楼是否合法，主要取决于是否符合当地城乡规划、是否履行了审批手续以及建设过程是否遵守了相关规定。以下从多个角度进行详细分析：
一、合法建设的前提
符合城乡规划：
- 在宅基地上建二层楼前，需确保该行为符合当地的城乡规划要求，包括建筑的高度、间距、外观等方面都与规划保持一致。这是判断建设行为是否合法的基本前提。
履行审批手续：
- 按照《中华人民共和国土地管理法》和《中华人民共和国城乡规划法》的规定，需向当地乡（镇）人民政府提出申请，并经过县级人民政府批准，取得建设工程规划许可证和宅基地用地审批等必要文件。这些文件将明确房屋的建设位置、面积、层数等具体要求。
- 审批流程通常包括向村委会提出申请，经村民会议或村民代表会议讨论通过后，再报乡镇政府审核，最终由县级人民政府批准。
二、可能被视为违建的情况
未经审批擅自建设：
- 若未向相关部门提出申请或申请未获得批准就自行在宅基地上加盖二层，由于缺乏合法的手续，这种行为很可能会被认定为违建。
- 相关部门有权责令停止建设，甚至要求拆除违法加盖的部分。
不符合规划和标准：
- 超出规定面积：各地对宅基地的面积及房屋的建筑面积有明确规定。若加盖二层后，房屋总面积超过当地标准，超出部分将被视为违建。
- 违反建筑规范：新建的二层房屋在设计、施工等方面需符合国家或地方的建筑安全、消防等规范要求。如结构设计不合理、影响消防安全通道等，都可能导致被认定为违建。
影响他人权益：
- 若加盖二层的行为影响了相邻权利人的合法权益，如通风、采光、排水等，也可能面临违建认定。例如，新建的二层房屋遮挡了邻居房屋的采光，且拒不整改，就可能被认定为违建。
三、法律后果与建议
法律后果：
- 未经审批或违反规划和标准建设的二层房屋，可能面临被责令停止建设、限期改正、罚款甚至拆除等法律后果。
- 若因违建行为给他人造成损失，还需承担相应的民事赔偿责任。
建议：
- 在决定是否在宅基地上建二层楼之前，务必先了解并遵守当地的相关法规和政策。
- 如有任何疑问或不确定的地方，应咨询当地的规划、土地或建设部门，以获得明确的指导和帮助。
- 通过合法途径进行建设，不仅能避免不必要的法律纠纷，还能确保自身权益得到保障。
总结来说，宅基地上建二层楼是否合法，关键在于是否符合当地城乡规划、是否履行了审批手续以及建设过程是否遵守了相关规定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。