建设工程案件可以约定仲裁。以下从法律依据、约定方式、注意事项及法律后果等角度为你详细分析：

一、法律依据

根据《中华人民共和国仲裁法》第二条的规定，平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷，包括建设工程合同纠纷，在双方自愿并达成仲裁协议的前提下，可以通过仲裁方式解决。这一规定为建设工程案件中约定仲裁提供了明确的法律基础。

二、约定方式

在建设工程合同中约定仲裁，通常需要在合同中明确写入仲裁条款，或者另行签订独立的仲裁协议。仲裁条款或协议应包含以下关键内容：

1. 请求仲裁的意思表示：即双方明确同意将可能发生的争议提交仲裁解决，而非通过诉讼或其他方式。
2. 仲裁事项：应清晰列出哪些争议属于仲裁范围，如工程质量、工期延误、工程款支付等，确保仲裁条款的明确性和有效性。
3. 选定的仲裁委员会：双方应共同选定一个具体的仲裁委员会，如中国国际经济贸易仲裁委员会或其他地方仲裁委员会，并明确其名称，避免使用模糊表述导致仲裁协议无效。

三、注意事项

1. 仲裁机构的明确性：在约定仲裁时，必须确保所选仲裁委员会的名称准确无误，且该机构客观存在，以避免因仲裁机构约定不明而导致的仲裁协议无效。
2. 仲裁规则的遵循：双方应了解并遵循所选仲裁委员会的仲裁规则，包括仲裁程序、仲裁费用等，以确保仲裁过程的顺利进行。
3. 仲裁与诉讼的选择：仲裁和诉讼是两种不同的争议解决方式，一旦选择仲裁，就排除了法院对争议的管辖权。因此，双方在约定仲裁时应充分考虑其特点和优势，如仲裁通常具有高效、专业、相对灵活的特点，但也可能存在费用较高、程序相对复杂等风险。
4. 仲裁协议的独立性：仲裁协议独立于建设工程合同本身，即使合同无效或被撤销，仲裁协议仍然有效。这意味着，即使合同出现问题，双方仍需按照仲裁协议的约定通过仲裁解决争议。

四、法律后果

1. 有效仲裁协议的效力：一旦建设工程合同中约定了有效的仲裁条款，当事人就排除了向法院起诉的权利。发生纠纷后，只能向约定的仲裁委员会申请仲裁，除非仲裁协议被认定为无效。
2. 无效仲裁协议的情形：若仲裁协议约定的仲裁事项超出法律规定的仲裁范围、由无民事行为能力人或限制民事行为能力人订立、或一方采取胁迫手段迫使对方订立，则仲裁协议无效。此时，当事人可以向人民法院起诉解决争议。
3. 仲裁与诉讼的衔接：如果建设工程合同中没有约定仲裁管辖，或者约定不明确，当事人仍然可以向人民法院起诉。此外，对于发生了合同约定的仲裁事项以外的争议，当事人同样可以选择向人民法院起诉来解决。

举例说明：假设在一个大型基础设施建设项目中，发包方和承包方在合同中明确约定了仲裁条款，并选定了某知名仲裁委员会作为争议解决机构。当项目执行过程中发生工程质量争议时，双方按照仲裁条款的约定向选定的仲裁委员会提起了仲裁申请。最终，仲裁委员会根据双方提供的证据和法律规定作出了裁决，解决了争议。

综上所述，建设工程案件可以约定仲裁，但务必确保仲裁协议的合法性、有效性和明确性。如果你在建设工程案件中遇到了争议解决方面的问题，或者需要进一步了解仲裁的相关规定和程序，可以直接向我咨询。