用人单位一般不能仅以调休方式不支付加班工资，但在特定情况下，如休息日加班且调休后，用人单位可不支付加班工资。以下是对这一问题的详细分析：

一、法律规定

根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：

1. 安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；
2. 休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；
3. 法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。

二、具体分析

1. 工作日加班：

   • 如果用人单位安排劳动者在工作日延长工作时间，那么必须按照法律规定支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬，不能通过调休来替代加班工资。

2. 休息日加班：

   • 如果用人单位安排劳动者在休息日工作，原则上应安排补休。如果安排了补休，那么用人单位可以不支付加班工资。
   • 但是，如果用人单位无法安排补休，那么必须按照法律规定支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。

3. 法定休假日加班：

   • 在法定休假日安排劳动者工作的，用人单位必须支付不低于工资的百分之三百的工资报酬，且不能通过调休来替代加班工资。

三、实际案例与建议

• 实际案例：假设某员工在周末被安排加班，且用人单位在后续时间内为其安排了调休。在这种情况下，用人单位可以不支付该员工周末的加班工资，因为已经通过调休进行了补偿。但是，如果该员工在法定节假日被安排加班，那么无论是否安排调休，用人单位都必须支付加班工资。

• 建议：

  • 作为劳动者，应了解自己的权益，并在遇到用人单位以调休方式不支付加班工资时，及时与用人单位沟通或寻求法律援助。
  • 作为用人单位，应遵守相关法律法规，合理安排劳动者的工作时间和休息时间，确保劳动者的合法权益得到保障。如果确实需要安排劳动者加班，应按照法律规定支付加班工资或安排补休。

四、特殊情况说明

• 在某些特殊情况下，如因自然灾害、事故等不可抗力因素导致用人单位需要紧急安排劳动者加班的，可能存在一定的灵活性。但即便如此，用人单位也应尽量在后续时间内为劳动者安排补休或支付加班工资，以体现对劳动者权益的尊重和保护。

综上所述，用人单位不能仅以调休方式不支付加班工资，除非是在休息日加班且已经安排了补休的情况下。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。