核心结论：在担保失效且申请调解期间，若担保人同意归还相关款项或履行担保责任，可按以下方式处理：

1. 明确同意归还的具体内容与范围

   • 操作要点：首先，需与担保人以书面形式（如协议、确认书等）明确其同意归还的具体款项金额、归还方式（一次性或分期）、归还期限等关键要素。同时，要确认该归还行为是否涵盖因担保失效可能产生的其他责任，如利息、违约金等。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》相关规定，民事法律行为可以采用书面形式、口头形式或者其他形式。但为避免后续纠纷，书面形式更为稳妥，它能清晰地固定双方的权利义务。
   • 风险提示：若未明确上述内容，可能导致在履行过程中双方对归还的范围、期限等产生争议，增加维权成本。

2. 调解程序中的处理

   • 操作要点：如果正在申请调解，应及时将担保人同意归还的情况告知调解机构。调解机构可以根据双方的新意愿，调整调解方案，促成双方达成新的调解协议。新的调解协议应明确担保人归还的具体安排以及原担保失效后的相关处理事宜。
   • 法律依据：调解机构在调解过程中，会根据双方的真实意愿和实际情况进行协调。依据《人民调解法》，经调解达成的调解协议，具有法律约束力，当事人应当按照约定履行。
   • 风险提示：若未及时告知调解机构担保人的新意愿，可能导致调解方案与实际情况不符，影响调解效果，甚至使调解失败。

3. 对原担保合同及相关法律关系的影响

   • 操作要点：担保人同意归还的行为，并不当然使原担保合同恢复效力，但可能构成对原债务的履行或新的债务承担。需要分析原担保合同失效的原因，如果是因主合同履行完毕、撤销等原因失效，担保人同意归还可能是基于新的法律关系；如果是因担保期限届满等原因失效，担保人同意归还可视为新的担保意愿或债务加入。
   • 法律依据：根据《民法典》中关于担保合同、债务承担等相关规定，担保合同的效力受多种因素影响，担保人同意归还的行为需结合具体情况判断其法律性质。
   • 风险提示：若对原担保合同及相关法律关系分析不准确，可能导致在后续履行或纠纷处理中，无法正确主张权利或承担义务。

4. 后续履行与监督

   • 操作要点：在担保人同意归还后，要按照约定的方式和期限监督其履行。可以要求担保人提供一定的担保措施（如提供抵押物、保证人等），以保障归还义务的履行。同时，保留好相关证据，如转账记录、沟通记录等，以备不时之需。
   • 法律依据：根据《民法典》中关于合同履行和证据的规定，当事人应当按照约定全面履行自己的义务，同时，证据是维护自身合法权益的重要依据。
   • 风险提示：若不进行后续履行监督和保留证据，一旦担保人违约，可能因缺乏证据而无法有效维护自己的权益。

总结：在担保失效且申请调解期间担保人同意归还，需从明确归还内容、调整调解方案、分析法律关系以及后续履行监督等方面进行处理。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可直接向我咨询。