兄妹分别成家后，能否在一个部门上班，这个问题主要取决于他们所在单位或公司的具体规章制度以及相关法律法规的规定，而非直接由婚姻家庭法律所决定。不过，我可以从几个相关角度为你分析：
单位规章制度角度：
- 许多单位或公司为了内部管理的公平性和避免潜在的利益冲突，会制定相关的规章制度来限制或禁止有亲属关系（包括兄妹关系）的员工在同一部门或关键岗位上工作。
- 如果单位有这样的规定，那么兄妹即使分别成家，也可能需要遵守这一规定，不能在同一部门上班。
法律法规角度：
- 在一般的劳动法律法规中，并没有直接规定兄妹不能在同一部门上班。劳动法主要关注的是劳动者的权益保护、劳动合同、工作时间、工资福利等方面。
- 但是，如果兄妹在同一部门上班可能引发利益冲突、不公平竞争或违反单位内部管理规定，那么单位有权根据内部规章制度进行管理和调整。
实际操作角度：
- 即使单位没有明确的规章制度禁止兄妹在同一部门上班，但在实际操作中，如果兄妹的职位或职责存在潜在的利益冲突，或者可能影响单位的工作氛围和团队凝聚力，单位也可能会考虑进行岗位调整或人员安排。
建议：
- 如果你或你的兄妹面临这样的情况，首先建议查阅所在单位或公司的规章制度，了解是否有关于亲属关系员工在同一部门工作的限制或规定。
- 如果单位有相关规定，那么需要遵守这些规定，可能需要考虑岗位调整或寻找其他工作机会。
- 如果单位没有相关规定，但你认为在同一部门上班可能引发问题或不适，也可以与单位的人力资源部门或上级进行沟通，寻求合理的解决方案。
总结来说，兄妹分别成家后能否在一个部门上班，并没有一个绝对的答案，而是取决于单位的具体规章制度、相关法律法规以及实际操作中的情况。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。