企业职工姐妹的配偶是否可以在同一部门上班，需结合企业规章制度、亲属回避政策及具体岗位性质综合判断，法律未作绝对禁止但企业有权合理限制。以下从不同角度展开分析：

1. 法律层面：无绝对禁止性规定，但需防范利益冲突

• 《劳动合同法》及《公司法》：未明确禁止亲属（包括姻亲关系）在同一企业或部门工作，但要求企业建立合理的利益冲突防范机制。例如，若姐妹配偶在同一部门担任财务与审批岗位，可能因亲属关系影响公正性，企业可依据内部规定调整岗位。
• 《国有企业领导人员廉洁从业若干规定》（如适用）：对国有企业管理人员亲属的任职有更严格限制，要求回避直接上下级关系或可能影响公正履职的岗位。私营企业可参照此精神制定规则。

2. 企业规章制度：以内部政策为准

• 亲属回避制度：多数企业（尤其是金融、审计、采购等敏感领域）会制定《亲属回避管理办法》，明确禁止直系亲属（如配偶、父母、子女）及三代以内旁系亲属（如姐妹、堂表兄弟姐妹）在同一部门或存在利益关联的岗位工作。姐妹的配偶属于“姻亲关系”，是否纳入回避范围需看企业具体规定。
• 岗位特殊性：即使企业无明确回避政策，若两人岗位涉及财务审批、人事考核、招投标等核心权力环节，企业可能以“避免利益冲突”为由调整岗位或拒绝录用。

3. 实践建议：企业与员工均需主动规避风险

• 对企业：
  1. 制定清晰的亲属回避政策，明确回避范围（如直系亲属、姻亲、特定旁系亲属）及岗位限制；
  2. 新员工入职时要求申报亲属关系，定期核查在职人员亲属任职情况；
  3. 对已存在的亲属共职情况，评估岗位风险，必要时调整分工或岗位。
• 对员工：
  1. 入职前主动向企业披露亲属关系，避免隐瞒导致后续纠纷；
  2. 若企业无明确规定，可与HR沟通确认岗位是否涉及利益冲突；
  3. 如因亲属关系被调岗或解雇，需核实企业行为是否符合规章制度及劳动法（如是否提前通知、支付补偿等）。

总结：姐妹的配偶能否在同一部门工作，法律未一刀切禁止，但企业可通过内部制度合理限制。建议双方提前了解企业政策，企业也应完善规则以平衡管理需求与员工权益。如有具体案例或企业制度细节，可进一步向我咨询。