大学与银行进行合作，银行支付相应款项，这一行为在合法合规的前提下是可行的。不过，具体是否合法合规，需要从多个角度进行详细分析：

一、合作协议的合法性

1. 协议内容：大学与银行之间的合作协议必须明确双方的权利和义务，包括合作目的、合作方式、款项支付条件、支付方式、违约责任等。协议内容应符合相关法律法规的规定，不得违反公序良俗或损害社会公共利益。
2. 签订程序：合作协议的签订应遵循双方内部的决策程序，如大学可能需要经过校务会或董事会的审议批准，银行则需要经过内部审批流程。确保签订程序的合法性和合规性，是合作协议有效性的重要保障。

二、款项支付的合规性

1. 资金来源：银行支付的款项应来源于其合法经营所得，不得使用非法资金或违反金融监管规定的资金进行支付。
2. 支付目的：款项支付应明确用于合作协议约定的目的，如支持大学的教学科研、学生资助、基础设施建设等。不得将款项用于非法活动或与合作协议无关的其他用途。
3. 税务合规：银行在支付款项时，应依法履行税务申报和缴纳义务，确保税务处理的合规性。同时，大学在接收款项时，也应按照税法规定进行税务处理。

三、监管要求的遵守

1. 金融监管：银行作为金融机构，其与大学的合作应遵守金融监管部门的相关规定，如贷款政策、资金用途监管等。确保合作行为不违反金融监管要求，是维护金融市场稳定和防范金融风险的重要一环。
2. 教育监管：大学作为教育机构，其与银行的合作也应遵守教育主管部门的相关规定，如不得将教育经费用于非教育用途、不得违规收取费用等。确保合作行为符合教育监管要求，是维护教育秩序和保障学生权益的重要保障。

四、可能存在的法律风险及防范

1. 合同纠纷：如果合作协议内容不明确或双方对协议理解存在分歧，可能引发合同纠纷。为防范此类风险，建议在签订合作协议前，双方应充分沟通、明确协议内容，并在协议中约定争议解决方式，如仲裁或诉讼等。
2. 违规风险：如果合作行为违反相关法律法规或监管要求，可能面临行政处罚或法律责任。为防范此类风险，建议双方在合作过程中密切关注法律法规和监管要求的变化，及时调整合作策略和行为方式。

建议：大学与银行在合作过程中，应确保合作协议的合法性和合规性，明确款项支付的目的和方式，遵守相关监管要求，并密切关注可能存在的法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询，我会根据具体情况为你提供专业的法律意见。