针对您入职后只有劳动合同的电子扫描件这一情况，我理解您的担忧，并会为您提供详细且专业的解答。

首先，需要明确的是，纸质劳动合同的扫描件或照片并不等同于电子劳动合同。电子劳动合同的生成、传递、储存等应当以满足《电子签名法》等法律法规为前提，确保合同的完整、准确、不被篡改，并且采用符合法律规定的电子签名形式。若您手中的只是纸质合同的扫描件，那么它并不能完全替代正式的电子劳动合同，也不能免除用人单位对纸质合同做好保存工作的义务。

接下来，我建议您采取以下步骤来处理这一问题：

1. 与用人单位沟通：

   • 首先，与您所在单位的人力资源部门或相关负责人进行沟通，明确表达您对于只有劳动合同电子扫描件的担忧。
   • 询问单位是否能够提供正式的电子劳动合同，或者是否可以补签一份纸质劳动合同以确保您的权益。

2. 了解电子劳动合同的签订流程：

   • 如果单位愿意提供电子劳动合同，您可以要求了解具体的签订流程，包括如何确保电子签名的合法性和有效性。
   • 确保在签订过程中，您的身份得到真实认证，且签署是出于您本人的意愿。

3. 保留相关证据：

   • 在与单位沟通的过程中，保留好所有的聊天记录、邮件往来等证据，以备不时之需。
   • 如果单位无法提供正式的电子劳动合同或补签纸质合同，您可以考虑将这些证据作为您与单位之间存在劳动关系的证明。

4. 咨询法律专业人士：

   • 如果您对电子劳动合同的法律效力或签订流程存在疑问，可以咨询法律专业人士或当地劳动保障部门，以获取更准确的法律意见。

5. 关注合同内容：

   • 无论您最终获得的是电子劳动合同还是纸质劳动合同，都请务必仔细阅读合同内容，确保合同中的条款符合您的期望和法律法规的要求。

最后，我想强调的是，劳动合同是您与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。因此，确保合同的合法性和有效性对于保护您的权益至关重要。如果您在处理这一问题过程中遇到任何困难或疑问，请随时与我联系，我会尽力为您提供帮助和支持。