复议被申请人未在法定期限内提交证据，复议机关在特定情形下自行调取证据是合法的，但需严格遵循法定条件和程序。以下从不同角度为您详细分析：
一、复议被申请人未在法定期限内提交证据的法律后果
根据《中华人民共和国行政复议法》及相关规定，复议被申请人（即作出具体行政行为的行政机关）有义务在法定期限内提交作出具体行政行为的证据、依据和其他有关材料。如果被申请人未在法定期限内提交，通常视为该具体行政行为没有证据、依据，复议机关可以决定撤销、变更或者确认该具体行政行为违法。
二、复议机关自行调取证据的合法性
法定情形下的合法性：
- 在某些特定情形下，如案件事实复杂、涉及专业性问题或需要进一步查明事实等，复议机关认为有必要自行调取证据的，可以依法进行。这种调取证据的行为是为了更准确地查明案件事实，保障复议决定的公正性和合法性。
- 例如，如果复议被申请人未提交的证据对于查明案件事实至关重要，且该证据确实存在且可获取，复议机关在遵循法定程序的前提下，可以自行调取。
程序要求：
- 复议机关自行调取证据时，必须严格遵守法定程序。这包括通知相关当事人、保障当事人的陈述和申辩权利、对调取的证据进行质证和认证等。
- 复议机关在调取证据时，应当确保证据的合法性、真实性和关联性，避免调取与案件无关或非法获取的证据。
限制条件：
- 复议机关自行调取证据并非无限制的。它必须在复议被申请人未在法定期限内提交证据，且该证据对于查明案件事实至关重要的情况下进行。
- 如果复议被申请人已经提交了足够的证据来支持其具体行政行为，或者复议机关认为通过其他方式（如要求被申请人补充证据、听取当事人意见等）能够查明案件事实，则无需自行调取证据。
三、实际操作中的建议
对复议申请人的建议：
- 如果您作为复议申请人发现被申请人未在法定期限内提交证据，可以向复议机关提出异议，并要求复议机关依法处理。
- 同时，您也可以积极提供与案件相关的证据和线索，协助复议机关查明案件事实。
对复议机关的建议：
- 复议机关在处理此类案件时，应当严格遵守法定程序和规定，确保复议决定的公正性和合法性。
- 在决定是否自行调取证据时，应当充分考虑案件事实、证据的重要性以及调取证据的可行性和必要性等因素。
对复议被申请人的建议：
- 作为复议被申请人，您应当在法定期限内积极提交证据、依据和其他有关材料，以支持您的具体行政行为。
- 如果因特殊原因无法按时提交，应当及时向复议机关说明情况并申请延期提交。
举例说明：假设在一个行政处罚复议案件中，复议被申请人未在法定期限内提交处罚决定的证据和依据。复议机关在审查过程中发现，处罚决定可能涉及专业性问题且案件事实复杂。为了更准确地查明案件事实，复议机关决定自行调取相关证据。在调取过程中，复议机关严格遵守了法定程序和要求，确保了证据的合法性和真实性。最终，复议机关根据调取的证据和双方当事人的陈述和申辩，作出了公正的复议决定。
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