在起诉时案由选择错误的情况下，法院在判决中通常不会直接表述为“变更案由”，而是会根据实际审理查明的法律关系性质，对案件进行重新定性，并在判决中明确阐述其认定的法律关系及理由。以下从几个方面进行详细分析：
一、法院对案由的认定与调整
法院的主动审查权：
- 法院在受理案件后，有权对原告提出的案由进行审查。如果法院认为原告提出的案由与案件实际法律关系不符，法院可以依职权调整案由，以确保案件审理的准确性和公正性。
案由调整的依据：
- 法院调整案由的依据主要是案件事实和法律规定。法院会通过审理查明的事实，结合相关法律法规，确定案件真正的法律关系性质，并据此调整案由。
二、判决中的表述方式
不直接表述“变更案由”：
- 法院在判决中通常不会直接使用“变更案由”这样的表述。因为案由的调整是法院内部对案件性质的一种认定，而不是对原告起诉行为的直接回应或修改。
明确阐述法律关系及理由：
- 法院会在判决中明确阐述其认定的法律关系性质，并给出相应的理由。例如，如果原告以合同纠纷为由起诉，但法院审理后认为实际法律关系为侵权纠纷，法院会在判决中说明为何认定为侵权纠纷，并据此作出判决。
三、对当事人的影响及应对建议
对当事人的影响：
- 案由的调整可能会影响当事人的诉讼策略和预期结果。因此，当事人在起诉时应尽量准确选择案由，以避免不必要的诉讼风险和成本。
应对建议：
- 仔细研究案件事实和法律规定：在起诉前，当事人应仔细研究案件事实和相关法律规定，确保选择的案由与案件实际法律关系相符。
- 咨询专业律师：如果当事人对案由的选择存在疑问或不确定，可以咨询专业律师的意见。律师可以根据案件具体情况和法律规定，为当事人提供准确的案由选择建议。
- 关注法院的审查意见：在案件审理过程中，当事人应关注法院对案由的审查意见。如果法院认为案由需要调整，当事人可以积极配合法院的工作，提供必要的证据和材料，以确保案件能够得到公正、准确的审理。
四、实际案例参考
在实际司法实践中，有许多因案由选择错误而导致法院调整案由的案例。例如，在一起合同纠纷案件中，原告以买卖合同纠纷为由起诉被告要求支付货款。但法院审理后发现，双方实际并未签订书面买卖合同，且交易方式更符合承揽合同的特征。因此，法院将案由调整为承揽合同纠纷，并据此作出了判决。
综上所述，当起诉的案由不对时，法院在判决中通常不会直接表述为“变更案由”，而是会根据实际审理查明的法律关系性质对案件进行重新定性，并在判决中明确阐述其认定的法律关系及理由。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。