老板发工资扣税是合法的，但必须依法进行。以下是对这一问题的详细解释：

法律依据

根据《中华人民共和国个人所得税法》的规定，工资、薪金所得属于个人所得税的征税范围。这意味着，员工从雇主那里获得的工资收入，是需要按照法律规定缴纳个人所得税的。因此，老板在发放工资时扣除个人所得税，是符合法律规定的。

扣税方式

1. 代扣代缴：根据《中华人民共和国税收征收管理法》的规定，扣缴义务人（即雇主）有义务代扣代缴员工的个人所得税。这意味着，老板在发放工资时，会根据员工的工资收入和适用的税率，计算出应缴纳的个人所得税，并从工资中扣除，然后代为缴纳给税务机关。

2. 税率和速算扣除数：个人所得税的税率和速算扣除数是根据员工的工资收入来确定的。税率采用超额累进税率，即工资越高，适用的税率也越高。速算扣除数则是为了简化计算而设定的一个固定数额。

合法扣税的条件

1. 依法申报：老板必须按照法律规定，向税务机关申报员工的工资收入和应缴纳的个人所得税。

2. 准确计算：老板在计算应缴纳的个人所得税时，必须准确无误，不能多扣或少扣。

3. 及时缴纳：老板必须按照规定的时间，将代扣代缴的个人所得税及时缴纳给税务机关。

非法扣税的情况

如果老板在扣税过程中存在以下行为，则可能构成非法扣税：

1. 未依法申报或缴纳：老板没有按照法律规定向税务机关申报员工的工资收入和应缴纳的个人所得税，或者没有及时缴纳代扣代缴的税款。

2. 多扣或少扣税款：老板在计算应缴纳的个人所得税时，存在错误或故意多扣、少扣税款的行为。

3. 以扣税为名克扣工资：老板以扣税为名，实际上是在克扣员工的工资，这种行为也是违法的。

员工权益保护

如果员工发现老板在扣税过程中存在违法行为，可以采取以下措施来保护自己的权益：

1. 与老板沟通：首先，员工可以与老板进行沟通，了解扣税的具体情况，并要求老板提供相关的税务申报和缴纳证明。

2. 向税务机关举报：如果员工认为老板存在非法扣税的行为，可以向当地税务机关进行举报，并提供相关证据。

3. 寻求法律援助：如果员工的权益受到严重侵害，可以寻求法律援助，通过法律途径来维护自己的权益。

总结来说，老板发工资扣税是合法的，但必须依法进行。员工在了解扣税情况的同时，也有权保护自己的合法权益不受侵害。如果你对工资扣税有任何疑问或发现老板存在非法扣税的行为，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。